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探讨长链非编码RNA LINC00261在Barrett食管、食管腺癌组织中的表达及其作用机制。分别通过以下方法进行探讨:取20例正常食管鳞状上皮组织,20例Barrett食管组织及20例食管腺癌组织分别进行石蜡包埋,利用RecoverAll?Total Nucleic Acid Isolation Kit for FFPE Tissues试剂盒提取总RNA,利用qRT-PCR技术检测LINC00261在组织中的表达变化;将正常食管鳞状上皮细胞系(Het-1A)、Barrett食管细胞系(BE CP-A)及Barrett食管相关腺癌细胞系(OE33和skgt4)接种于含10%胎牛血清的1640培养基中,置37°C、5%CO2培养箱中培养,取对数生长期细胞并利用Takara公司的总mRNA试剂盒提取细胞总RNA,利用qRT-PCR技术检测LINC00261在细胞中的表达变化;将人胚胎干细胞培养于人胚胎成纤维细胞饲养层,取对数生长期细胞分别给予不同浓度的酸暴露及胆酸(总浓度0,100,300,1000μM)处理,并于处理24,48,72h后提取细胞总RNA;采用qRT-PCR法检测LINC00261的表达变化;采用生物信息学的方法分析LINC00261可能调控的下游靶基因;构建LINC00261慢病毒载体并转染人胚胎干细胞,qRT-PCR技术验证LINC00261在细胞中的表达变化,采用Western blot技术检测LINC00261慢病毒转染后FOXA2蛋白表达水平的变化;采用FOXA2慢病毒表达载体转染人胚胎干细胞,观察高表达FOXA2对酸暴露及胆酸处理后人胚胎干细胞中CDX2及MUC2蛋白表达的影响;采用SPSS 17.0统计学软件对实验结果进行分析,P<0.05认为差异具有显著性。通过上述研究发现,与正常食管鳞状上皮组织相比,LINC00261在Barrett食管及食管腺癌组织标本中表达均显著上调;与正常食管鳞状上皮细胞系相比,LINC00261在Barrett食管细胞系及Barrett食管相关腺癌细胞系中表达水平也显著增高;与正常对照组相比,酸暴露及胆酸诱导可导致LINC00261表达显著上调,并表现出一定的浓度依赖性及时间依赖性;生物信息学分析表明LINC00261恰好位于叉头框蛋白A2(forkhead box protein A2,FOXA2)上游启动子区域,提示LINC00261可能参与FOXA2表达的负性调控;进一步实验发现高表达LINC00261可显著抑制FOXA2蛋白的表达水平;酸暴露及胆酸可诱导人胚胎干细胞FOXA2表达下调,CDX2(肠型分化标志物)及MUC2(柱状上皮标记物)表达上调,而高表达FOXA2可以抑制酸暴露及胆酸诱导下CDX2(肠型分化标志物)及MUC2(柱状上皮标记物)表达。综上,我们的研究发现LINC00261在Barrett食管的发生发展中表达显著升高,其表达上调可通过负性调控FOXA2进而诱导胚胎干细胞中CDX2及MUC2的表达,从而在Barrett食管的发生过程中发挥重要作用。