自上世纪三十年代以来，中国的鱼类学家对长江流域鱼类区系做了多次调查，并报道了大量内陆水体鱼类的系统学、生物地理学和生态学研究成果。然而，对于鱼类多样性格局的综合分析相对较少，这限制了长江流域鱼类多样性保护策略的科学制定。本文尝试对长江流域淡水鱼类多样性作综合分析，同时对长江流域银鱼的多样性进行了调查，并对银鱼类群的分子系统发育关系进行了探讨。　 首先，本研究分析了长江流域淡水鱼类物种多样性的信息。在长江流域已报道 ３６１种和亚种的淡水鱼类，其中有 １７７ 种是长江流域特有种。习惯上，长江被划分为三个江段，即上游、中游和下游。通过本研究分析发现长江鱼类分布格局并不支持这三个江段的划分方法。水利工程建设是长江流域对鱼类多样性产生影响最大的一个威胁因素。上游鱼类受三峡大坝和其它水坝的影响最大，应该受到优先保护。要恢复鱼类多样性资源，一个紧迫的任务就是恢复长江与其湖泊间的通道。长江中部湖群应该被保护起来以维持洄游鱼类的产卵和摄食生境。本研究表明很有必要在长江流域界定鱼类资源生态保护区的地点和范围，从而来缓解鱼类多样性所面临的生态危机。　 其次，本研究对长江流域淡水鱼类沿着海拔梯度的物种多样性、物种分布幅度和物种体形大小模式进行了探索。结果表明低海拔地区的淡水鱼类物种数高于高海拔地区。特有种物种数占总物种数的比例在中海拔高度(2300-2400 m)出现峰值。依据海拔梯度，鱼类群落结构聚类分析把鱼类群落划分成 0-1000 m、1000-2000 m、2000-3600 m、3600-4000 m、> 4000 m 这样 5 大类，较好地反映了长江流域的地形特征。物种密度在中等海拔高度出现峰值。总物种、特有种和非特有种的物种分布幅度均表现出随着物种海拔分布中点值的上升而增加的趋势，这和 Rapoport 规律一致。长江流域淡水鱼类最大体长对数值的频率分布呈向右倾斜的特点。在所分析的 6 个主要类群中，只有鲤科(Cyprinidae)鱼类的物种体形大小是随着物种海拔分布中点值的上升而显著增加的，而其它 5 科鱼类的物种体形大小和物种海拔分布中点值之间没有显著相关关系。结果表明特定类群的适应性影响物种体形大小和物种海拔分布中点值间的关系。特有种的物种体形大小和海物种拔分布中点值之间为显著的正相关关系，但是总物种和非特有种的物种体形大小和物种海拔分布中点值之间没有显著相关关系。 第三，本研究对安徽安庆沿江自然保护区所属湖泊进行了鱼类多样性调查。共记录到鱼类 １１ 目 １８ 科 ５９ 属 ８１ 种，其中长江水系特有种 １１ 种。鱼类物种组成以鲤科鱼类为主，占到该区域鱼类总物种数的 ６２．９％，而鲤科鱼类又以鮈亚科与鲌亚科为主。鱼类区系大致由五个复合体组成，以中国江河平原区系复合体为主体，其次是南方热带区系复合体和古代第三纪区系复合体。另外，尚有部分种类属中印山区区系复合体 1<WP=6>长江流域鱼类生物多样性空间格局兼论银鱼的生物多样性与系统发育和海水区系复合体。根据鱼类的生活习性，鱼类可划分为 ３ 个生态类型，以洄游型鱼类和湖泊型鱼类为主体，其次是江河型鱼类。　 依据中国鱼类志资料，并经校对与整理，安徽安庆沿江自然保护区所属湖泊在１９８０ｓ 前的多次鱼类调查共记录到鱼类 １２ 目 ２２ 科 ５９ 属 ７８ 种。本次调查记录到鱼类１１ 目 １８ 科 ５９ 属 ８１ 种。这样，连同本次调查，该自然保护区共记录到鱼类 １２ 目 ２４科 ６８ 属 ９８ 种。目前，就鱼类物种数而言，洄游鱼类趋于减少，而湖泊定居鱼类则趋于增多。本次调查还表明该自然保护区各湖鱼类物种数明显多于１９７０ｓ年代末到１９８０ｓ年代初的调查。各湖鱼类物种数具有两个特点：首先是鱼类物种数与湖泊面积之间基本符合物种－面积关系，即湖泊面积越大，鱼类物种数越多；其次渔业模式影响鱼类物种数，以养为主的湖泊鱼类物种数一般低于半养半天然的湖泊。长江及其湖泊生态系统洄游性鱼类的最大特点是具有丰富的江湖洄游性鱼类。本次调查表明该自然保护区仍具有较为丰富的江湖洄游性鱼类，但未能发现溯河洄游性鱼类。　 安徽安庆沿江自然保护区鱼类资源是长江流域鱼类生物多样性不可或缺的重要组成部分。其鱼类物种数占长江流域淡水鱼类总数的 ２２．３％，占长江中下游鱼类总数的 ３６．８％，占长江中下游湖泊鱼类总数的 ５０．９％。与通江湖泊洞庭湖与鄱阳湖 １９７０ｓ的鱼类资源调查相比较，洞庭湖与鄱阳湖的鱼类物种数要比龙感湖与黄大湖的鱼类物种数多 ２０ 种左右。而与江湖阻隔湖泊太湖、巢湖、洪湖、梁子湖相比较，龙感湖与黄大湖的鱼类物种数均高于这些湖泊的鱼类物种数。　 第四，本研究在长江流域进行了银鱼多样性资源的初步调查。共记录到银鱼 5 属7 种。连同历史上的分布记载，共记录到银鱼 5 属 10 种。其中短吻间银鱼（Hemisalanxbrachyrostralis）和近太湖新银鱼（Neosalanx pseudotaihuensis）是长江流域的特有