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黑点病是一种世界范围内常见的柑橘真菌性病害，在中国江西，广西，广东，陕西，福建，湖南，重庆，上海等柑橘产区均有发生。该病原菌为间座壳科（无性态，拟茎点霉属），Diaporthe属具有很高的种群多样性。目前在世界范围内已经报道了22个种和柑橘有关。本研究目的在于鉴定在江西省引起柑橘黑点病的Diaporthe种，Diaporthe的种群结构。 在江西省的12个果园内，我们在两个柑橘品种（纽荷尔脐橙和南丰蜜桔）上收集并鉴定了802个单孢菌株。其中，420株来自于叶片，309株来自于果实，73株来自于枝条，病枝、病叶和病果均具有典型的黑点病症状。 我们从802个菌株中随机选取140个。基于5个位点(核糖体内转录间隔区(ITS)，转录延伸因子1-α（TEF)，β-微管蛋白（TUB），钙调蛋白（CAL），组蛋白-3（HIS））进行物种的分子鉴定。 从140个单孢菌株中共鉴定出27个Diaporthe种。其中发现了5个新种（种名尚未确定）。并在柑橘上首次报道了13个新纪录种D.apiculata,D.lagerstroemiae,D.mali,D.momicola,D.penetriteum,D.perniciosa and D.sennicola,D.eucalyptorum,D.longicicola,D.passifloricola,D.podocarpi-macrophylli,D.sackstonii,D.tectonendophytica，其中的6个新纪录种在中国首次发现。总的来说，在江西省发现了18个一起柑橘黑点病的Diaporthe种。南丰蜜桔上鉴定出19个种，纽荷尔脐橙上鉴定出17个种。南丰县发现了19个Diaporthe种，南康县发现了14个Diaporthe种，信丰县发现了4个Diaporthe种。同样的在叶片上分别发现了21个种，在果实上发现了11个种，枝条上发现了8个种。不同的柑橘品种和组织上，Diapothe citri均是优势种。