【摘 要】
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目的探讨宏基因组二代测序（Metagenomic Next-generation Sequencing,m NGS）技术在恶性血液病（Hematological malignancies,HM）合并感染患者的病原学诊断中的特点及临床应用。方法回顾性分析2019年1月至2020年12月在福建医科大学附属协和医院血液科住院的45例诊断为恶性血液病合并感染的患者的住院资料及临床标本,m NGS检测结果及
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目的探讨宏基因组二代测序（Metagenomic Next-generation Sequencing,m NGS）技术在恶性血液病（Hematological malignancies,HM）合并感染患者的病原学诊断中的特点及临床应用。方法回顾性分析2019年1月至2020年12月在福建医科大学附属协和医院血液科住院的45例诊断为恶性血液病合并感染的患者的住院资料及临床标本,m NGS检测结果及相应标本（包括外周血、肺泡灌洗液（Bronchoalveolar lavage fluid,BALF）、脓液、无菌体液等）的普通培养结果。描述其临床特点,比较m NGS检测新技术与传统培养检测的阳性率、检测耗时、检测病原体的种类及分布、病原体检测的一致性;在传统培养阴性的患者中,比较m NGS阳性与m NGS阴性患者治疗效果上的差别;并对m NGS检测的影响因素进行单因素分析。结果本研究符合入组条件的恶性血液病合并感染的患者共39例,23名男性,16名女性,平均年龄（48.33±14.66）岁。同时送检微生物培养并采用宏基因二代测序技术的临床标本共39份,标本类型包括:外周血样本（25份）,肺泡灌洗液样本（6份）,肺组织样本（3份）,脓液样本（1份）,无菌体液样本（4份）。m NGS检测的阳性率为71.79%（28/39）,而传统培养的阳性率为41.03%（16/39）,前者显著高于后者,两者之间存在统计学差异（P=0.011）。m NGS测序的平均检测时间（32.31±5.34）h要明显短于传统培养（91.64±14.77）h（P=0.02）。28份m NGS阳性患者中,共检测到病原体57株,其中细菌23株,真菌7株,病毒21株,特殊病原体6株;16例传统培养阳性患者中,共检测到病原体16株,细菌14株,真菌2株,m NGS对病毒、真菌、特殊病原体的检出率明显高于传统培养,且m NGS在检测细菌类病原体的种属方面亦更有优势。送检的39份标本中,12例m NGS与传统培养检测均为阳性,其中有2例m NGS与传统培养检出的病原体完全一致,6例m NGS与传统培养检出的病原体部分一致,4例m NGS与传统培养检出病原体完全不一致。在传统培养无法检测出病原体的患者中,根据m NGS的阳性结果制定相应抗病原微生物的治疗方案后,治疗效果显著好于经验性抗感染治疗效果（81.25%vs 28.57%）,差异具有统计学意义（P=0.026）。对m NGS检测的影响因素进行单因素分析,没有发现对m NGS病原体检出率有影响的临床因素存在。结论应用m NGS检测能够提高恶性血液病合并感染患者的病原体的检出率,特别是对于真菌、病毒以及特殊病原体的检测。在传统培养方法无法检测出病原体的患者中,m NGS检测可以作为临床有效的一种补充手段,从而很好的指导抗病原微生物治疗方案的制定,有助于提高治疗效果。m NGS在检测周期上短于传统培养,能够在短时间内快速检测病原体。未发现对m NGS病原体检测结果有影响的临床因素,m NGS检测技术不受临床多个因素影响,适用人群广泛,结果稳定性更好。
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