三色堇热激蛋白70(HSP70)基因的克隆及生物信息学分析

被引量 : 3次 | 上传用户:rg198938
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
热激蛋白(Heat Shock Protein,HSP)是生物体遭受胁迫时产生的一类可以对相关蛋白进行调控从而增强生物体抗性的保护性蛋白,普遍分布在各种生物体内。其中热激蛋白70(HSP70)是目前在基因和蛋白层面研究的最为深入的一种热激蛋白。三色堇(Violatricolor)花色丰富,花期颇长,是重要的花坛、盆栽观赏花卉,应用十分广泛。然而,当前绝大多数三色堇品种不耐高温导致应用受限。从较耐热三色堇种质中分离HSP70基因并进行相关生物信息学分析,对三色堇耐热性研究及培育出具有耐热新品种有重要意义。本试验以三色堇HAR为试材,对其进行42℃20min,40min,60min的热激处理,诱导HSP70基因表达。利用同源序列克隆法,在GenBank数据库中搜寻与堇菜科亲缘关系相近的植物HSP70基因序列,分析保守区域结构,设计扩增引物,应用PCR技术从三色堇HAR中扩增获得882bp的HSP70基因片段,再利用RACE技术获取三色堇HAR的HSP70基因的5’端和3’端序列,获得基因全长为2169bp,并对中间片段进行质粒连接,重组质粒构建,获得HSP70-pMD18-T重组质粒。利用生物信息学软件对三色堇HSP70全基因进行分析,最大开放阅读框长度为1950bp(124-2083bp),编码649个氨基酸。以开放为基础进行相关生物信息学分析。系统发育树分析显示,三色堇与欧洲油菜和盐芥的相似率为47%,亲缘关系较近。蛋白预测分析显示HSP70为膜外疏水蛋白,无信号肽位点,属于NBD-sugar-kinase-HSP70-Actin的超家族,与HSP70-1,HSP70-2和HSP70-3存在相似位点。
其他文献
随着现代社会的迅猛发展,阅读逐渐成为人们获取最新信息和知识的有效途径之一。对英语学习者来说,阅读在其学习过程中起着非常重要的作用。现今,初中英语阅读教学要求侧重于
随着城市居民生活水平的不断提高,其饮食消费结构也发生了变化,逐步由以高热量的食品为主转变为以低热量的食品为主。据统计,国内经济较发达城市居民的蔬菜摄入量已超过谷物
实验样本作为笔迹样本的一种,在笔迹鉴定中发挥着重要作用。实践中实验样本被大量应用,有时成为笔迹鉴定的主要样本甚至唯一样本,然而实验样本同时存在总体质量较差、采集程序不
通过分析城市空间结构的生长演化机制,研究城市空间结构与城市交通的互动关系。将城市空间结构的生长演化归纳为城市外部空间扩张和内部结构调整两个方面,指出二者均与城市交
日本作为世界上的经济大国,其国内的政治变化对周边国家乃至世界都会有影响。冷战结束以来,日本国内的政治右倾化趋势愈演愈烈,对亚太地区以及世界的和平与稳定都构成了巨大
为解决深圳市路内停车泊位的规划建设问题,分析了深圳市路内停车泊位的现状及存在的问题。总结了欧美、日本对路内停车泊位进行需求管理的经验,以及香港、台湾、广州市停车泊
<正>小学生辩论是一种灵活、生动,富有实践性的教学活动,不光能锻炼学生的口才,培养学生搜集、整理资料的能力,而且能了解学生的思想动向,用事实帮助学生明辨是非,引导成长的
应用室内试验得到的沥青混合料热粘弹性本构模型 ,根据三维空间热粘弹性理论推导了沥青路面温度应力的计算公式 ,对沥青路面低温状态下温度应力进行了计算分析。与试验结果的
目的:探讨联合使用厄贝沙坦和美托洛尔治疗高血压性心脏病的效果及安全性。方法:选取我院2011年11月至2013年12月期间收治的70例高血压性心脏病患者作为研究对象。联合使用厄
目的 :探讨分析应用碘仿氢氧化钙抑菌糊剂对乳牙根尖病变进行根管治疗的临床效果。方法 :选取2012年1月至2013年1月间我院收治的乳牙慢性根尖周炎患儿98例(共120颗牙)作为研