二十一世纪是互联网信息大爆炸的时代，网络媒体信息传播呈现及时性、交互性、复杂性、裂变性等新特征。这些特征给企业危机公关带来了全新的机遇和挑战。网络媒体迅速地改变了传统传播格局，传统的议程设置功能也会发生变化。在企业危机公关中积极探索网络媒体议程设置的作用和新特征，对企业展开危机公关工作有着重要的理论意义和现实意义。本文采用内容分析法、文献分析法和个案研究法等研究方法，主要以2013年“农夫山泉标准门”事件为研究对象，验证在企业危机公关中网络媒体的议程设置对公众认知的三个层次作用，进而分析出企业危机公关中网络媒体议程设置呈现出的特征，最后为企业危机公关提出建设性的建议和对策。企业危机公关中网络媒体议程设置对公众认知三个层次的作用，与传统媒体的议程设置作用大致一致。相较于传统媒体，网络媒体对农夫山泉危机事件报道后的第二天甚至是当天，公众关注度急剧上升，可见公众对网络新闻反应速度更快。同时公众的注意力转移速度也非常快，很容易被网络媒体报道的其他事情所代替。网络媒体报道议程紧紧围绕着“企业之间的商业竞争”，而且强调程度最高，公众因此对农夫山泉事件“商业竞争”这一属性关注度也最高，从而在一定程度上忽略了“产品问题”这一关键属性。网络媒体和公众对农夫山泉危机事件关注角度并不完全一致，但是在共同关注的“商业竞争、产品问题和承担责任”这三个角度上保持着一致的优先顺序。另外，本文通过数据统计分析发现，网络媒体议程呈现出多种特征：网络媒体新闻信息来源多样化，主要源自于传统的报纸、杂志和国家新闻网；网络媒体中议题的互动性增强；网络媒体很有可能过分强调危机事件的某一特定属性或特征。最后，针对企业危机公关，本文提出了若干建议对策。企业危机公关中要注重网络媒体议程设置作用，积极主动设置议程；利用“自媒体”传播，积极引导公众舆论；深度挖掘大数据，传播信息趋向公众认知需求。