中国集装箱运输以其高效、便捷、安全的特点成为交通运输现代化的重要形式。加快发展集装箱运输对促进经济贸易发展、改善经济结构和运输结构、扩大对外开放具有十分重要的意义。本文正是在中国物流高速发展的新时期针对当前集装箱运输中存在的空箱闲置、电子商务技术落后、集装箱企业恶性竞争等现状提出合理化建议。本文首先分析了集装箱运输与经济增长之间的辨证关系，结合中国经济周期，分析集装箱运输与国民生产总值、进出口贸易、进出口结构等经济变量的关系；然后，分别分析了集装箱运输中的电子商务问题、空箱利用问题、集装箱班轮运输联盟等问题。电子商务是时代发展的必然趋势，它是企业降低成本，改善效益和提高生产力的必然选择。集装箱市场需要电子商务。其成因包括对集装箱运营商的影响，对整个物流业产生的影响等。在集装箱运输市场上利用电子商务的用途主要在于建立客户资料，全方面的服务体系和通过电子商务建立企业联盟等。 集装箱班轮运输联盟是目前全球普遍存在的形式，本文分析了班轮运输联盟形成的原因和运做模式，并对之进行经济分析，最后提出对慎重对待企业集团的组建，寻求最佳结合点；企业兼并应以专业化分工为主要特征；大力培育和扶植企业技术创新，调整经济结构；创建一体化的集装箱联盟；用法律规范市场等建议。