病原微生物的防控工作已经成为我国卫生部门十分重视的一项工作。我国目前微生物鉴定工作存在的问题有:手工操作多、主观判断多、自动化程度低、微生物数据信息共享闭塞、国外市场垄断微生物检测核心技术等。针对以上问题,本文对病原微生物样本孵育拍照和后续处理的业务进行了调研与分析,设计并实现了病原微生物样本处理及孵育拍照系统的软件平台。本文通过对微生物检测业务的流程进行分析,分析了系统的功能需求,详细阐述了系统的主要功能,进而分析了系统的非功能性需求。根据需求分析,明确系统的总体架构,对系统的功能模块进行划分。该系统将总共分为六大模块:设备参数信息展示、样本信息、仪器异常信息提示、单步复位、孵育处理、箱仓维护。系统的基本框架采用SSM框架。系统与PLC控制系统的交互采用Netty框架和modbusTCP协议,且传输的报文信息严格遵循接口规范,达到通信可靠性,将获取的箱仓信息、异常信息以及下发的动作复位信息展示在相关页面。系统采用HTTP协议与LIS系统对接,获取样本基本信息并上传样本性质,并将解码以后的样本信息展示在关联的前端页面。在孵育处理模块中,使用Quartz定时任务框架实现样本孵育时间、样本拍照时间以及下次拍照时间的设置;通过webService协议与相机开口对接,并获取样本孵育图片,通过灰度变换、二值化等算法分析处理图片得到样本性质。并在拍照过程中通过TCP/IP协议执行控制3D扫描设备。在仪器异常信息提示模块中,RabbitMQ消息队列实现样本孵育任务优先级的设置,确保从PLC传来的异常信息优先处理。通过angularJS、HTML等技术实现前端页面数据的展示。系统的数据库选择MySQL来存储系统中的数据信息。最后对系统进行功能性测试和非功能性测试。测试结果表明,微生物样本处理及孵育拍照系统基本满足实际功能和性能需求。