基于S1核酸酶切的PD--L1适配体合理截短及其信号双放大传感器的建立

来源 :北京化工大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:BING_YAN3414
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核酸适配体是一种寡核苷酸序列,能与类似抗原抗体结合的方式识别目标分子,并具有多种优势,可广泛应用于检测、医药及成像等领域。但通过SELEX筛选的适配体可能无法直接应用,需要进行截短优化以提高其靶向特异性和应用稳定性。目前,适配体截短主要是通过基于分子对接模拟预测的经验式去除核苷酸的方法来实现的,这通常需要繁琐的试错过程,有时甚至会导致潜在的错误预测结果。PD-L1是重要的肿瘤标志物,同时也是用药伴随诊断指标及治疗靶点。目前,肿瘤细胞表面表达的PD-L1主要通过ELISA检测,然而,从病人身上提取肿瘤组织的要求和单克隆抗体的生产成本在一定程度上使这一策略不能令人满意。一项研究显示,血清中的外泌体PD-L1可以作为一种潜在的肿瘤标记物用于预后评估。因此,开发检测血清中PD-L1的技术具有光明的应用潜力。
  本文提出了一种简单、快速的基于S1核酸酶消化的方法来合理截短PD-L1适配体Apt80。由于空间位阻的存在,S1核酸酶的非酶解碱基应构成Apt80与PD-L1之间的真正识别和结合区。通过这种策略,截短的适配体Apt38与PD-L1结合具有更显著的构象变化程度,并且比Apt80(109.68nM)具有更低的Kd值(51.34nM),同时保留了优良的特异性。基于截短的Apt38,采用Exo I辅助靶循环策略和Q-PCR技术,制备了信号双放大适配体传感器。利用该信号双放大传感器,实现了在缓冲体系中以0.076ng/mL和人血清中以0.3625ng/mL的LOD选择性识别PD-L1。所提出的策略省时省力,并对截短其它大分子的适配体也有一定的参考价值。同时,该信号双放大传感器具有在诸如灵敏度、特异性、操作难度、检测费用方面具有明显的优势,可以辅助临床大夫评估肿瘤患者的病况,判断是否适合使用免疫治疗抑制剂。
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