测定基因组序列可以帮助人类认知生物体的生命规律，从而对农业，医学，环境等领域产生深远的影响;然而受限于测序技术，测序仪每次只能读出基因组上的一个短片段，而不是一次读出完整的基因组序列。因此，从短片段中恢复出完整基因组序列（即拼接）是生物信息学的一个基本问题。　　测序技术的不断发展，给基因组序列拼接带来了新的可能，也带来了新的挑战。第三代的测序数据具有读段（reads，即测序仪测得的碱基序列片段）长、错误率高(ins/del错误多)的特点，其长读段给解决拼接问题中的难题-重复序列带来了希望;但是因为其高错误率，所以要想直接使用三代数据进行拼接，则需要较高的测序深度，导致测序成本很高。与之相反，二代测技术可以产生准确率高的、短的读段。因此，使用三代（低测序深度）和二代测序数据进行联合拼接，具有低花费、高质量的优势。　　本文提出了一种新的二、三代测序数据联合的拼接算法，开发了拼接器ARCS23，主要思想是:先用已有的二代拼接软件对二代数据进行拼接，得到拼接图，再将该图分解成若干个小的局部拼接图;并行地将三代数据联配到局部拼接图上，给图中的边加权，对每个局部拼接图选择最重路径进行简化，对最重路径中最后一个结点重新建局部拼接图并简化，得到一些最重路径相连的contigs路径;检查这些contigs路径的覆盖和连接情况，并做去覆盖、连路径的操作;联配三代数据与contigs路径，从而指导contigs路径的先后顺序，得到最后的拼接结果。　　本文的创新点主要有:　　(1)提出了划分拼接图的思想，对比直接处理复杂的拼接图，该方法简便可行，同时，划分后的局部拼接图可以并行处理，大大降低了程序的运行时间;　　(2)引入最重路的思想简化局部拼接图;　　(3)充分利用了拼接图的连接信息。　　实验结果表明，ARCS23可以部分解决了仅用二代数据无法解决的重复序列的问题，使拼接结果长度大大增加。与SSPACE-LongRead和HyBridPBcR的对比实验表明:在二代拼接结果好的情况下，ARCS23的长度和准确率上都有很大的优势，而且ACRCS23不需要高的三代的测序深度，从而有效降低了成本。