随着政府机构改革的进行,部分政府部门逐步实行垂直管理,其目的旨在避免地方的保护主义、提高政府工作效率、对机要部门实行统筹管理,但随之出现了内部控制制度缺失而导致的腐败滋生等问题。近些年来,我国对一般行政单位的内部控制研究不断深入,内部控制制度不断完善。但垂直管理模式下的行政单位,不管是在行政运行还是监督上与一般行政部门存在较大的差异,单单依照一般行政单位内部控制办法还无法达到有效控制管理的目的。因此,研究适用于垂直管理模式的内部控制迫在眉睫。本文以作者所在天津市H区规划分局为研究对象,深入探讨垂直管理模式下行政单位内部控制相关问题。通过分析天津市H区规划分局基本情况及内部控制的现状,梳理单位内部控制评价与监督、单位层面、业务层面及风险评估四个方面存在的问题,主要从垂直管理角度分析问题存在的原因,除了行政单位内部控制存在的共性原因之外,还包括垂直管理模式方面的原因,具体包括垂直管理模式内部控制制度不完善、垂直管理模式下部门监督弱化、垂直管理模式下人员缺乏积极性等。最后,作者从从单位层面改善内部控制环境、业务层面完善财务会计内部控制、加强垂直管理模式风险识别和评估和建立健全垂管模式内部控制评价与监督机制四方面提出针对性建议。本文立足于垂直管理模式的行政单位这一主体,在完善H区规划分局内部控制的同时,将一般行政单位内部控制体系的研究进一步细化,也为垂直管理行政部门建立有效的内部控制制度提供了借鉴。