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本研究以萧山鸡、仙居鸡、灵昆鸡、萧山鸡×仙居鸡杂交F1代、爱拔益加鸡(分别简称XS、XJ、LK、XS×XJ、AA,下同)五种鸡共142只个体为供试群体,采用克隆测序首次得到了鸡L型钙离子通道α1亚单位编码基因(CACNA1S)的5’-UTR～exon1序列。利用PCR-SSCP技术,研究了鸡该区域的SNPs及其与肉质和屠体性状的关联性。结果如下:(1)通过克隆测序首次获得了鸡CACNA1S基因5’-UTR～exon1共1863bp的序列(GenBank登录号:GQ184725),从而完善了Genbank中关于CACNA1S基因的收录。(2)PCR-SSCP结果表明:5’-UTR发现有4个SNPs位点:213(C→T)、551(G→A)、716(C插入/缺失)、1711(C→G)。当551位点(G→A),调控元件HSF的顺序发生了变化;当1711位点(C→G),调控元件由ADR1变为ADR1、M2F1、STRE和GATA-1。(3)SNPs213和SNPs716位点分别发现有AA、BB和JJ,KK两种基因型,群体基因频率分别为0.2254、0.7746和0.5141、0.4859;SNPs551和SNPs1711分别发现MM、MN、MN和XX、XY、YY三种基因型,群体基因频率分别为0.4683、0.5317和0.4648、0.5352。SNPs213、SNPs551位点XS、XS×XJ、AA三个群体为低度多态(PIC＜0.25),其余两个群体为中度多态(0.25＜PIC＜0.50)。SNPs551、SNPs1711位点整个供试群体都为中度多态(0.25＜PIC＜0.50)。(4)最小二乘分析和显著性检验表明:SNPs551 NN和MN基因型的IMP含量极显著(P＜0.01)大于MM型,NN和MN基因型的IMF含量显著(P＜0.05)大于MM型,NN基因型的Glu含量极显著(P＜0.01)大于MN、MM型。SNPs716位点JJ基因型的胸肌率极显著(P＜0.01)大于KK型,KK基因型的IMP和Glu含量极显著(P＜0.01)大于JJ型,JJ基因型的IMF含量极显著(P＜0.01)大于KK型。SNPs1711位点YY基因型的全净膛率和胸肌率显著(P＜0.05)大于XY和XX型,YY和XY基因型的半净膛率极显著(P＜0.01)大于XX型,YY和XY基因型的胸肌率极显著(P＜0.01)大于XX型。YY基因型的IMF含量显著(P＜0.05)大于XY和XX型,YY基因型的Glu含量显著(P＜0.05)大于XY和XX型。可考虑将CACNA1S基因作为影响鸡肉质和屠体性状的候选基因。