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牛不仅具有重要的经济价值更有很高的生物价值。越来越多的证据表明,非编码RNA在转录后水平对动物的生长发育起了很重要的调节作用。Micro RNAs(mi RNAs)是一类内源性的长度大约在22nt左右的非编码单链RNA分子,广泛地分布在动、植物及病毒中。它可以通过与靶基因m RNA的3’UTR区域碱基互补配对的方式,来使靶m RNA发生降解或者抑制其翻译。牛mi RNA研究相对滞后,本研究构建了由3月龄胎儿、6月龄胎儿、12月龄青年牛3个不同生长时期的多个组织混合的mi RNA的c DNA文库,然后对3个文库进行高通量测序,结合生物信息学方法对牛的mi RNA进行深度挖掘,并通过茎环RT-q PCR的方法检测了部分mi RNA在3个不同生长时期的组织表达谱,取得的主要成果如下:构建了3个由处于3种不同生长时期的多个组织mi RNA混合的c DNA文库,通过对3个文库的高通量测序,分别获得了24665837,19963158,20286502的原始读段(raw reads)。经过质量控制后,得到高质量的reads(mapped reads)的数量分别为23619093条,18746297条,18455215条。3个文库中得到的mi RNA序列长度均主要分布在20~24nt,且在22nt处达到峰值。并且3个文库中的Unique Reads在牛的所有染色体上均有分布。采用mi RDeep程序对测序结果进行分析,3个文库中分别获得了696,646,605个mi RNAs,其中已知mi RNA的数量分别为449,435,430个;未知mi RNA的数量分别为247,211,175个。采用茎环法RT-q PCR对9个mi RNAs进行了组织表达谱研究,发现bta-mi R-1、bta-mi R-133、bta-mi R-206在背最长肌和心肌中特异性表达,bta-mi R-378在背最长肌中特异性表达,bat-mi R-338、bta-mi R-421、bta-mi R-2453、Novel_mi R-381、Novel_mi R-86在3月龄胎儿的各个组织中均有不同程度的表达,在6月龄胎儿和青年时期时仅在个别组织中表达。本研究通过对3个c DNA文库的高通量测序并结合生物信息学分析,发现了大量的牛mi RNA序列,同时鉴定了部分mi RNA的表达谱,为后续牛的基因组学相关研究奠定了理论基础。