生物安全是国家安全的重要组成部分。在经历了SARS和生物恐怖袭击后，各国对传统生物安全构建了较为完善的监管体系。但随着生物技术的进步和发展，转基因食品的出现，非传统的生物安全风险不断增大，最新研究显示食物可直接参与人体内基因的表达，因此防控食源性生物安全是实现生物安全新的重点和难点。加之近年来，食品安全事件频发，全球每年有数百万人因食用不安全食品而患病或死亡，食源性生物安全问题越来越受到各国政府的高度重视，已经成为公共卫生安全领域的研究热点。本研究以生物安全和食品安全为关键词，检索了中国期刊全文数据库中食源性生物安全相关文献共1014篇；采取多种形式组织生物安全、预防医学、临床医学和公共卫生管理等领域的12位专家进行了头脑风暴；向30位相关领域专家发出调查问卷30份（其中回收有效问卷30份），并重点分析食源性生物安全争论和“三鹿”奶粉食品安全事件中医院在食品安全方面具有前哨预警作用，特别依据食源性生物安全最直接损害的消化系统和我国肝病的特点，选取2008～2011年西南地区五所军队医院在不明原因肝损伤等主要18类肝脏疾病的流行病学特征，对以下科学问题进行了系统的分析和阐释：1、生物安全的概念、特征以及我国在生物安全领域所面临的主要挑战；2、食源性生物安全的科学依据，找到生物安全和食品安全的结合点，分析我国生物安全的食品威胁现状以及现有监控体系存在的问题；3、论证医院在我国生物安全事件监控体系中的作用；4、充分发挥和挖掘军队医院特色和优势，构建基于军队医院的国家生物安全监控体系。研究结果表明：随着技术的进步和发展，食源性生物安全威胁越来越大，新变化和新特点使得现有监控体系尚无法有效的应对这一威胁。对于我国人口基数大，食品需求量大的现实情况，我国将面临越来越大的食源性生物安全风险，因此防控食源性生物安全是实现我国国家生物安全的重要保证。依据病从口入的基本科学道理，从医院角度出发，提出了完善现有生物安全监控体系的新思路和新体系，实现医院职能由事后救治向事前预警、参与防控、健康管理等多角度职能转变。充分发挥军队医院的特色和优势，构建基于军队医院专家识别、数据分析、关键科室疾病哨点监测等为主要内容的国家生物安全监控体系，可望更加有效地应对基于食源性生物危害。本研究在全面分析食源性生物安全防控现状和不足的基础上，从医院角度出发，提出了完善食源性生物安全监控的新思路和新途径，并充分挖掘军队医院在防控食源性生物安全的作用，提出了相关监控体系建设方案，可望为我国防控食源性生物危害提供新的思路和选择，保证人民身体健康，实现国家生物安全。