YB-1在多形性胶质母细胞瘤中调控microRNA加工分子机制的研究

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Y-box结合蛋白1(YB-1)是含有进化保守的冷休克结构域的核酸结合蛋白家族成员。YB-1参与DNA复制以及mRNA转录、剪接、稳定性和翻译的调控。在多种癌症中,YB-1蛋白水平的增加与癌症的发展和不良预后有关,目前尚不清楚肿瘤发生过程中YB-1在转录后水平的关键靶标。  microRNA(miRNA)是一类长度在22~23 nt的小RNA分子,通过抑制靶mRNA翻译或促进靶mRNA的降解,在转录后水平调控基因表达。在多种癌症中,miRNA的表达水平会发生异常改变,并影响肿瘤的发生发展。  本课题中,发现YB-1是一种调控多形性胶质母细胞瘤(glioblastomamultiforme,GBM)中miRNA加工的新因子。通过单核苷酸分辨率紫外交联免疫沉淀与高通量测序相结合的方法(iCLIP-seq),我们在全基因组范围对内源YB-1与RNA相互作用进行了分析,发现YB-1主要结合在pre-mRNA和mRNA的编码区,并偏爱性识别UYAUC序列。我们的数据还显示YB-1能够大量结合在pri-/pre-miR-29b-2的末端环区域。有意思的是,YB-1能够通过阻碍Microprocessor和Dicer分别对其底物的募集,调控miR-29b-2的加工。通过对公共数据库的数据分析,发现YB-1在GBM中表达上调,并与miR-29b的表达呈负相关性。进一步的实验结果说明YB-1在GBM细胞中可以通过抑制miR-29b的表达促进肿瘤细胞的增殖。因此,我们的研究发现了YB-1在调控非编码RNA表达中的新功能,并对认识肿瘤发生的机理有重要意义。
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