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目的:本研究确认中国阿尔茨海默病(AD)人群外周血中糖酵解相关基因的甲基化水平与AD发生、发展中的作用。分析阳性基因PFKFB3、DLD、GAPDHS、LDHB、PKLR、LDHC、HK3和ALDOC启动子区甲基化对阿尔茨海默病的潜在诊断价值,以及联合不同基因能否提高对AD的诊断价值。
方法:选取2015年-2016年在宁波市第一医院、宁波大学附属医院和宁波市康宁医院就诊的AD患者64例,同时收集年龄匹配且无痴呆家族史的正常对照61例,对他们的基线资料和实验室检查结果进行列表登记。于清晨抽取他们的空腹血液,用磁珠法提取DNA,通过亚硫酸氢盐转化后,再用实时荧光定量PCR的方法检测PFKFB3、DLD、GAPDHS、LDHB、PKLR、LDHC、HK3和ALDOC基因启动子区域的CpG岛甲基化率,运用秩和检验分析8个候选基因的甲基化水平在AD组和对照组之间的甲基化水平,再用ROC曲线评估8个基因甲基化水平预测AD发病的效果。采用双荧光素酶实验探究目的基因片段能否调控基因表达。
结果:我们的结果显示,与对照组相比,AD组的PFKFB3、GAPDHS、LDHB、ALDOC、LDHC和HK3的甲基化水平显著提高(P均<0.05),中位数和四分位数分别为84.87(45.97-122.30)vs.6.77(3.00-15.84);5.43(4.09-7.57)vs.0.34(0.23-0.56);0.09(0.07-0.10)vs.0.05(0.03-0.07);0.21(0.17-0.30)vs.0.13(0.08-0.18);2.80(2.16-3.47)vs.1.62(1.10-2.22);0.27(0.23-0.33)vs.0.15(0.10-0.24)。而PKLR的甲基化水平则是在AD组低于对照组(P=2.68E-18),中位数和四分位数分别为0.09(0.07-0.10)vs.0.47(0.25-0.70),此外DLD的甲基化水平在AD组和对照组之间无统计学差异。ROC曲线显示PFKFB3、GAPDHS、LDHB、ALDOC、LDHC和HK3高甲基化对于AD均有一定的诊断价值,可作为潜在的AD诊断生物标志物,且GAPDHS的诊断效果最好(AUC分别为0.909、0.958、0.829、0.776、0.779和0.777)。用双荧光素酶报告基因测定评估PFKFB3、GAPDHS、LDHB、ALDOC、PKLR、LDHC和HK3的靶区域的功能活性。除了LDHC外,插入另外六种基因启动子片段都能够显着增加荧光素酶表达水平(P=0.00002,P=1.39E-7,P=0.0002,P=0.0003,P=0.001,P=0.000036)。
结论:PFKFB3、GAPDHS、LDHB、ALDOC、LDHC和HK3甲基化在AD组高于对照组,PKLR则是在AD组低于对照组,外周血中PFKFB3、GAPDHS、LDHB、ALDOC、LDHC和HK3高甲基化可作为AD的潜在诊断生物标志物,且PFKFB3、GAPDHS、LDHB、ALDOC、PKLR和HK3目的片段具有启动功能。
方法:选取2015年-2016年在宁波市第一医院、宁波大学附属医院和宁波市康宁医院就诊的AD患者64例,同时收集年龄匹配且无痴呆家族史的正常对照61例,对他们的基线资料和实验室检查结果进行列表登记。于清晨抽取他们的空腹血液,用磁珠法提取DNA,通过亚硫酸氢盐转化后,再用实时荧光定量PCR的方法检测PFKFB3、DLD、GAPDHS、LDHB、PKLR、LDHC、HK3和ALDOC基因启动子区域的CpG岛甲基化率,运用秩和检验分析8个候选基因的甲基化水平在AD组和对照组之间的甲基化水平,再用ROC曲线评估8个基因甲基化水平预测AD发病的效果。采用双荧光素酶实验探究目的基因片段能否调控基因表达。
结果:我们的结果显示,与对照组相比,AD组的PFKFB3、GAPDHS、LDHB、ALDOC、LDHC和HK3的甲基化水平显著提高(P均<0.05),中位数和四分位数分别为84.87(45.97-122.30)vs.6.77(3.00-15.84);5.43(4.09-7.57)vs.0.34(0.23-0.56);0.09(0.07-0.10)vs.0.05(0.03-0.07);0.21(0.17-0.30)vs.0.13(0.08-0.18);2.80(2.16-3.47)vs.1.62(1.10-2.22);0.27(0.23-0.33)vs.0.15(0.10-0.24)。而PKLR的甲基化水平则是在AD组低于对照组(P=2.68E-18),中位数和四分位数分别为0.09(0.07-0.10)vs.0.47(0.25-0.70),此外DLD的甲基化水平在AD组和对照组之间无统计学差异。ROC曲线显示PFKFB3、GAPDHS、LDHB、ALDOC、LDHC和HK3高甲基化对于AD均有一定的诊断价值,可作为潜在的AD诊断生物标志物,且GAPDHS的诊断效果最好(AUC分别为0.909、0.958、0.829、0.776、0.779和0.777)。用双荧光素酶报告基因测定评估PFKFB3、GAPDHS、LDHB、ALDOC、PKLR、LDHC和HK3的靶区域的功能活性。除了LDHC外,插入另外六种基因启动子片段都能够显着增加荧光素酶表达水平(P=0.00002,P=1.39E-7,P=0.0002,P=0.0003,P=0.001,P=0.000036)。
结论:PFKFB3、GAPDHS、LDHB、ALDOC、LDHC和HK3甲基化在AD组高于对照组,PKLR则是在AD组低于对照组,外周血中PFKFB3、GAPDHS、LDHB、ALDOC、LDHC和HK3高甲基化可作为AD的潜在诊断生物标志物,且PFKFB3、GAPDHS、LDHB、ALDOC、PKLR和HK3目的片段具有启动功能。