miR-199a-3p在人脂肪细胞诱导分化过程中的表达变化及调控因素分析

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目的(1)探讨miR-199a-3p在人脂肪细胞分化前后以及在肥胖人群内脏脂肪组织中的表达规律;(2)针对miR-199a-3p进行生物信息学分析,预测miR-199a-3p的靶基因及其生物学功能;(3)检测炎症相关因子leptin(瘦素)、resistin(抵抗素)、TNF-α(tumor necrosis factor-alpha,肿瘤坏死因子 α)、IL-6(interleukin 6,白介素 6)、FFAs(free fatty acids,游离脂肪酸)对 miR-199a-3p表达水平的影响。方法(1)采用Real time PCR技术,检测人前体脂肪细胞分化过程中miR-199a-3p 的表达水平;(2)运用 NCBIMapviewer、miRbase、UCSCGenome Browser等在线工具获取并分析miR-199a-3p基因的序列特征;运用miRanda、DIANAmT、miRDB、Pictar、Targetscan、miRWalk 等在线数据库预测 miR-199a-3p潜在的靶基因,选取至少在5个数据库里均预测到的基因作为候选靶基因;同时查阅文献已验证的靶标,针对所获靶基因集分别进行功能富集分析(Gene Ontology,GO)和信号转导通路富集分析(Pathway Enrichment);应用pubmed搜索工具检索并总结关于miR-199a-3p已有的功能研究;(3)采用Real time PCR技术检测leptin、resistin、TNF-α、IL-6、FFAs干预对人成熟脂肪细胞中miR-199a-3p表达水平的影响。结果(1)与人前体脂肪细胞相比,miR-199a-3p在人成熟脂肪细胞中的表达水平显著上调(P<0.05);与正常体重人群相比,miR-199a-3p在肥胖人群内脏脂肪组织中的表达量也显著增加(P<0.05);(2)生物信息学分析结果显示,miR-199a-3p在进化上高度保守,并且候选靶基因进行功能注释后显示主要参与磷酸代谢、细胞分泌、对糖刺激的反应、细胞迁移的调控、蛋白质氨基酸的磷酸化和脱磷酸化、细胞内信号的级联放大等生物学过程(P<0.05);(3)信号通路分析显示预测靶基因集合的信号转导通路显著富集于细胞内吞过程、p53信号通路、ECM受体相互作用、TGF-beta信号通路、shh信号通路以及黏合连接等过程(P<0.05);(4)leptin、TNF-α、IL-6及FFAs均显著上调人成熟脂肪细胞中miR-199a-3p的表达,而resistin显著下调人成熟脂肪细胞中miR-199a-3p的表达。结论(1)miR-199a-3p在成熟人脂肪细胞中的表达明显增加,同时高表达于肥胖人群的内脏脂肪组织中,提示miR-199a-3p可能参与调控脂肪细胞的分化过程、具有促进脂肪细胞分化的作用,可能参与调控肥胖的发生发展过程;(2)生物信息学分析提示miR-199a-3p可能通过调控靶基因参与调节脂肪细胞分化、胰岛素抵抗以及炎症反应的发生;(3)肥胖及胰岛素敏感性相关的细胞因子能够调控miR-199a-3p的表达,其中leptin、TNF-α、IL-6及FFAs均能显著上调成熟人脂肪细胞中miR-199a-3p的表达,,而resistin显著抑制miR-199a-3p的表达。以上研究结果为深入分析miR-199a-3p与肥胖、胰岛素敏感性之间的关系提供了可能的线索,有可能为肥胖及肥胖相关并发症的早期干预和防治提供了新的靶点。
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