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大多数陆地植物的根系皆能与丛枝菌根真菌（AMF）形成AM共生体,对提高宿主植物养分吸收、促进生长发育、缓解环境胁迫等方面具有积极作用。本研究以烟草（Nicotiana tabacum L.）为宿主植物,首先基于摩西斗管囊霉（Funneliformis mosseae,Fm）、根内根孢囊霉（Rhizophagus intraradices,Ri）、幼套近明球囊霉（Claroideoglomus etunicatum,Ce）、球状巨孢囊霉（Gigaspora margarita,Gm）共4株AMF菌株及3种不同氮效率品种（ZY100、K326、NC89）进行了菌株与品种组合的初步筛选试验;其次基于筛选结果采用15N同位素示踪法探索了AMF对氮吸收的偏好形态;基于上述研究结果采用15N茎注法探索了AMF对间作模式中氮转移的影响;最后采用高通量转录组测序手段对烟株根系进行了氮代谢解析。本文的主要结论如下:（1）4株AMF菌株均能侵染烟株根系,其侵染率在21.82%～41.6%。未接种情况下,不同氮效率品种在株高、干物质含量、根系生长状况、养分含量（N、P、K、Ca、Mg、Fe、Mn、Cu、Zn）、氮素代谢酶（NR、GS）及相关氮代谢酶基因表达（NRT1、Ni R1、Ni R2、Ni R3、Nt GS1、Nt GS2）等指标均整体表现为ZY100（低）4）2SO4、KNO3、Glu及其对应15N标记物为氮源,对AMF吸收的主要氮素形态进行试验探索表明,AMF对各氮素形态的吸收量存在显著差异。15N-Glu标记处理（N3）吸收量显著大于无标记处理（N0）,显示AMF可吸收一定量的Glu。在（NH4）2SO4、KNO3、Glu三者氮素形态共存时,AMF优先吸收NH4+,其吸收量分别是NO3-、Glu的1.35、2.94倍。就吸收的三者氮素总量而言,（NH4）2SO4、KNO3、Glu各占总氮吸收量的48.61%、36.10%、15.29%。（3）大豆/烟草间作系统中,在塑料固体分隔（PS）条件下,与未接种（CT）、单接种AMF（CE）、单接种根瘤菌（BJ）相比,双接种（CE+BJ）提高了大豆对氮的吸收,其增幅分别为93.1%、28.71%、39.62%;同等PS处理下,双接种（CE+BJ）的烟株对N的吸收量分别是未接种（CT）、单接种CE、单接种BJ处理的1.68、1.22和1.28倍。基于30μm尼龙网分隔（MS）的双接种体系中（CE+BJ）,大豆向烟株转移的氮量较CT、CE和BJ分别增加7.29、6.97和11.52mg/pot。不分隔体系中（NS）,烟株双接种（CE+BJ）较CT、CE、BJ分别增加6.44、7.63和12.48 mg/pot。综上,在大豆/烟草间作系统中同时接种AMF和根瘤菌,提高了间作系统的生物量累积,促进了大豆向烟株的氮素转移。（4）根系转录组测序分析表明,与未接种处理（CK）相比,烟草接种幼套近明球囊霉（Ce）,鉴别出4个硝酸盐转运蛋白（NRT1.10、NRT1.1、NRT1.7、NRT1.11）、4个多肽转运蛋白（PTR3-A、PTR1、PTR2、PTR5）、5个ABC超家族转运体蛋白（At ABCB4、At ABCB10、At ABCB14、At ABCB17、At ABCB18）及6个氮代谢酶基因（GS2、GLUL、GLTB、GLTD、GLT1、GDHA）。接种根内根孢囊霉（Ri）,鉴别出1个高亲和硝酸盐转运蛋白2.5（At NRT2.5）,7个硝酸盐转运蛋白（NRT1.10、NRT1.7、NRT1.11、NRT1.1、NRT1.1、NRT1、NRT2）、3个多肽转运蛋白（NRTPTR3-A、NRTPTR1、NRTPTR5）、7个ABC超家族转运体蛋白（At ABCB4、At ABCB5、At ABCC10、At ABCC14、At ABCB19、At ABCB17、At ABCB18）及8个氮代谢酶（GS2、GLUL、GLUD1、FM、CA、GS、GDH1、GDH2）。就接种两者AMF鉴别出的氮转运蛋白及氮代谢酶类型来看,接种Ce主要涉及了谷氨酸代谢途径,而接种Ri则完整参与了谷氨酸代谢、氰基氨基酸代谢、甲烷代谢及乙醛酸代谢途径。结果表明不同AMF对氮吸收、同化能力及参与的氮代谢途径不同。