串联重复序列是一些广泛的存在于真核生物和原核生物基因组中,肩并肩重复的DNA序列,它们在不同的个体之间由于重复数的不同,而造成长度的多态性.已经广泛的应用于细菌的流行病学调查、菌株鉴别、菌株分型等方面.在以往的研究中发现,鼠疫耶尔森菌(以下简称鼠疫菌)中存在着大量的串联重复序列,我们挑选了其中的三个基因座,对其进行PCR扩增和电泳分析.其中有两个基因座位于基因间隔区,引物分别是M28,M43;有一个基因座位于基因编码区引物是M34.这三个串联重复序列的核心序列长度分别为8bp,12bp和9bp.第一对引物M28在被检菌株中扩增出的串联重复数目有3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、14、15,分为12个型.第二对引物M43扩增出的串联重复数目有2、3、4、5、6,分为5个型.第三对引物M34扩增出的串联重复数目有4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、18、19、20,分为16个型.这三对引物全都涵盖的菌株有126株,包括了我国9个疫源地16个生态型的菌株.当把这三对引物综合起来分析时,扩增的126株菌其串联重复数目可以出现75种不同的组合,组合相同的菌株,都为同一生态型,且大多数分离于同一流行过程,只有少数几株菌例外.对它们进行聚类分析,我们发现,串联重复序列在某一地域内,其分型是跟菌株的生态型相关联的.