秦岭是我国种子植物分布的特有中心,也是我国具有国际意义的生物多样性关键地区。佛坪和长青自然保护区都是秦岭南坡中段的具有丰富生物多样性的代表性地区,也是国内大熊猫种群密度最高的地区,两个保护区内植物群落类型多样,垂直带谱分明,有着众多的古老孑遗植物和珍稀濒危保护植物。其中佛坪自然保护区在建立以前并没有进行过森林采伐,基本属无人为干扰的区域；而长青自然保护区白1967年开始即进行了大面积的采伐,海拔2800m以下的木本植物层几乎消失,但是这种长期大规模的砍伐活动对其物种多样性造成的影响还不清楚,因此迫切需要对该地区的物种多样性及其分布格局状况开展调查,对两地的物种多样性状况进行比较研究和分析,这对于保护我们的国宝大熊猫和其它珍稀濒危野生动物及其栖息地,对于研究和保护植物物种多样性均具有着重要的意义。本研究针对分布在佛坪和长青国家级自然保护区内的种子植物物种多样性、各种类型植物群落以及群落中的优势种种群进行了比较分析,结果表明：长期大规模的砍伐活动给长青自然保护区内的种子植物物种多样性、优势植物种群和植物群落均造成了广泛而深刻的影响。从物种多样性方面来看,分布在两地的植物物种组成有显著差异,相似系数只有20%左右。分布在两地的草本植物优势种组成差异较大；两地的木本植物优势种的种类差异不大,但是这些优势种的种群结构不尽相同：巴山冷杉、红桦、华山松和太白杨的种群结构在两地之间的差异显著,在佛坪的胸径或高度明显大于长青；在两地分布在中低海拔区域的锐齿栎、化香树、五裂槭、泡花树、湖北花楸、铁杉等优势种种群结构差异不显著。从两地的主要群落来看,两个保护区高海拔区域的太白红杉林保存完好,群落组成和结构差异不大：分布在长青中低海拔区域以栎林为主体的落叶阔叶林已经初步得到恢复,其群落的组成和结构与佛坪的差异也不大。巴山冷杉林在佛坪分布范围比长青更为广泛,长青的巴山冷杉林密度显著高于佛坪,而其平均高度和平均胸径小于佛坪；长青针阔叶混交林占的比例要比佛坪更火一些,该类型群落的立木密度一般高于佛坪,而其平均高度、平均胸径和胸部断面积和小于佛坪；佛坪桦林带内红桦占据了绝对优势,占分布样方的13.33%,长青的这一类型基本上被破坏且恢复较慢。基于上述分析结果,我们初步提出以下建议：草本植物是最具变化性的植物,包括种类、数量、分布等方面对环境变化的敏感度较大,可以从中选择一些喜荫的草本植物,其种类的增加和分布范围的扩大常可以作为环境恢复的标志；也可以从中选择一些喜阳耐旱的草本植物,其种类的减少和分布范围的缩小同样可以作为环境恢复的标志。长青的巴山冷杉、红桦、华山松、太白杨等优势种种群与佛坪差异较大,可以选做为重点监测的种群；长青的中高海拔区域的种子植物群落与佛坪差异较大,因此可以做为重点监测的群落。