融合蛋白adk-mUBA1在大肠杆菌中的表达及其应用

来源 :西南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:bingying888
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
泛素化修饰是一种广泛存在于真核生物体内的蛋白翻译后修饰,它是一个多酶级联反应,涉及到E1泛素激活酶、E2泛素结合酶和E3泛素连接酶,此过程还需要其它分子,如ATP、Mg2+等的参与。泛素化过程与机体的多种生理功能调控相关,如细胞的增殖分化、信号转导、蛋白定位、DNA损伤修复、自噬、生长发育和凋亡等。在人的细胞中有2个泛素激活酶(E1)、40多个泛素结合酶(E2)以及600多个泛素连接酶(E3)。体外泛素化反应在泛素化修饰研究中十分重要。其中一个关键的问题是如何获得大量有活性的E1、E2和E3以满足体外泛素化反应的要求。体外泛素化反应中,通常会用UBA1作为E1来起始泛素化反应,所以只有大量获得有活性的UBA1才能满足体外泛素化实验以及泛素相关样品制备的需求。目前UBA1的纯化方式有2种:第一种是通过富含UBA1的组织进行纯化;第二种是通过在昆虫细胞或大肠杆菌中过表达后进行纯化。两种纯化方式得到的UBA1的量均很少。因此,我们通过蛋白融合表达的方式提高了小鼠UBA1(mUBA1)在大肠杆菌中的表达。同时,在许多泛素化反应中融合表达的mUBA1比没有融合标签的mUBA1具有更好的活性。磷酸腺苷激酶(adk)是从细菌到哺乳动物几乎所有生物中都存在的一种蛋白,它能够催化2 mol ADP生成1 mol ATP和1 mol AMP。我们通过实验发现adk在大肠杆菌中表达量很高,融合adk也可以显著提高融合蛋白的表达量。通过融合adk与mUBA1,融合蛋白adk-mUBA1的表达量要显著高于之前其他文献中所表达的蛋白量,表达量约为mUBA1的10倍。通过对mUBA1表达量的提升,我们得到的纯蛋白量也得到提升。1 L菌液能够获得的mUBA1大约为1-3 mg的纯蛋白,而adk-mUBA1大约能够获得15-20 mg。从获得的纯蛋白量上对比,adk-mUBA1能够提升约8倍的蛋白量。通过优化亲和纯化条件和阴离子交换条件,能够获得纯度为90%以上的adk-mUBA1和mUBA1。Adk-mUBA1和mUBA1的蛋白性质相同,无论是UBA1通过硫酯键结合Ub,还是通过UBA1向UbcH5B转移泛素活性,或者是通过Ube2S直接形成泛素链活性,或是通过UbcH5B向不同类型的E3转移泛素形成泛素链的活性,二者没有明显差异。在某些反应中,adk-mUBA1的活性明显比mUBA1的活性更强。融合了adk后,adk-mUBA1能够同时具有adk的磷酸腺苷激酶活性和mUBA1的泛素激活酶活性,所以它能够通过adk水解ADP,提供ATP给mUBA1用以活化Ub,从而起始泛素化反应。有一些泛素化反应需要在细胞裂解液中进行。而细胞裂解液中含有大量的ATP水解酶,外源供给的ATP在很短的时间内就会被水解为ADP,从而无法供给mUBA1来活化Ub。现在解决的策略有两种:一是去除细胞裂解液中细胞膜成分(S100)。大量的ATP水解酶都存在于细胞膜上,去除细胞膜成分虽然会大大降低裂解液中的ATP水解酶,但同时也会损失很多的膜蛋白,并且效果也并不理想。二是通过ATP再生系统添加肌醇激酶和磷酸肌醇来通过ADP实现ATP再生。该策略通常只在S100中有作用,在全细胞裂解液中的效果并不显著。通过在细胞裂解液中的泛素化反应比较,adk-mUBA1能够合成的泛素链比mUBA1合成多一倍。通过UbcH5B C85S(UbcH5B C/S)直接在细胞裂解液中接受E1活化的Ub,发现adk-mUBA1也能够比mUBA1生成多约一倍的UbcH-O-Ub。Adk-mUBA1能够通过ADP来作为能源活化Ub,所以它比mUBA1更适合长时间的泛素化反应。Adk-mUBA1通过催化合成E2-O-Ub复合物,可以用于大量合成E2-O-Ub复合物相关的实验中。通过串联亲和纯化,我们获得了纯度约为90%的E2-O-Ub以用于实验研究。Adk-mUBA1还可用于如体外合成泛素链等化学化工合成,满足各种实验的需要。
其他文献
三峡大坝建成运行后,水库消落区的生态系统发生剧烈变动,消落区植被作为消落区生态系统的重要组成成分,对消落区生态环境保护具有积极而重要的意义。消落区植物在出露期从消落区土壤吸收大量氮磷钾营养以供自身发育和生长,但在蓄水水淹期间植物损失大量死亡残体,大量氮磷钾营养流失于水体。为探究三峡水库消落区植被水淹死亡引发的氮磷钾营养损失情况,本研究于2017年8月至2018年5月对三峡水库典型消落区的植被进行调
常村煤矿井田范围内铁路专用线下压煤量达3500万吨,在促进煤炭资源的综合开发利用的同时还要保障铁路的安全运营,因此开采沉陷动态预测显得尤为重要。为准确预测采动地表移动
在国家积极倡导加快生态文明体制改革,建设美丽中国的背景下,装配式建筑正处于蓬勃发展的新时期。框架-剪力墙结构拥有灵活自由的使用空间,可以满足多种建筑功能需求,又能保证侧移刚度,目前国内外学者对装配式框剪结构中的梁柱节点和剪力墙竖向连接已有许多研究并应用于实际工程之中,对于框架柱与剪力墙之间的连接方式则研究较少。为此,本文针对课题组提出的装配式组合键槽柱墙连接方式开展了抗剪性能研究,并结合研究结果进
当强激光场作用于原子分子体系时,由于激光场较强,电子受到激光场的作用可以与原子核对它的库伦作用相比拟,激光场的作用使原子分子的势能发生弯曲,电子有很大的几率从原子分
相比欧美发达国家,当前我国家庭在资产配置上面临储蓄率过高、房产投资过度和金融市场参与不足等问题。根据当前欧美发达国家家庭资产配置结构现状可以预见:随着我国城镇化进
在慢性感染或癌症的发生过程中,T细胞长期暴露于持续的抗原刺激或炎症信号,导致T细胞以分级的方式逐渐失去效应功能,通常称为T细胞耗竭(T cell exhaustion)。T细胞表面PD-1、CTLA-4、LAG-3、Tim-3和BTLA等抑制性受体高表达和共表达是耗竭T细胞的主要特征之一。本课题组前期的研究中,已经用差速离心法从多种小鼠/人肿瘤细胞培养上清以及肿瘤患者胸/腹水中成功募集到分泌型自噬
自由电子激光(FEL)可提供波长连续可调、高亮度、高相干性的短脉冲辐射,是原子分子物理学研究中一种重要的科学技术。目前,FEL主要朝着超短脉宽、超高强度、高相干性等方面发
泛素化修饰作为蛋白质翻译后修饰的一种常规修饰,在调节细胞各种过程中执行着非常重要的作用。经典的泛素化修饰主要通过E1泛素激活酶,E2泛素结合酶以及E3泛素连接酶对泛素的级联传递最后将泛素修饰到底物上,调节底物蛋白的稳定性、酶活性、细胞定位等。2007年,Daniela Hoeller等科学家提出在体外泛素化反应时,没有E3泛素连接酶参与的条件下底物蛋白通过泛素结合结构域(ubiquitin bin
随着计算机技术的不断发展,越来越多的大型专业应用软件在电力部门得到了广泛应用,之前需要人工完成的工作已逐步被计算机所替代。目前国内的很多供电企业在配电网的自动化水
目的 通过与传统的后腹腔镜保留肾单位手术(Retroperitoneal laparoscopic nephron-sparing surgery,RLNSS)的临床效果比较,评价 ZS 评分(zhongshan score)指导下经皮超选择