基于线粒体Cytb基因探讨武夷湍蛙的种群遗传结构及系统地理学研究

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武夷湍蛙(Amolops wuyiensis),隶属于蛙科(Ranidae)湍蛙属(Amolops),分布于我国东南部的安徽、浙江、福建和江西四省。本文利用线粒体基因片段作为分子标记,研究了武夷湍蛙种群的遗传结构和演化历史。我们成功测定了武夷湍蛙13个不同地理种群213个样本的线粒体Cytb基因序列,定义了81个单倍型。其单倍型多样性(hd)为0.918,核酸多样性(π)为0.03616。基于单倍型构建的ML和Bayesian系统发育树,除了少数低支持度的节点外,二者的拓扑结构大致相同。所有单倍型可分成四大支系,其中武夷山种群的单倍型聚在两个不同的支系上,推测武夷山种群可能来自两个不同的祖先种群并发生了二次接触。AMOVA分子变异分析表明武夷湍蛙线粒体遗传变异主要存在于组间(92.92%),而种群间的差异较小(6.24%)。分子钟结果表明各支系分离发生在上新世晚期和更新世早期,武夷湍蛙最早的分歧发生在3.30百万年前。水系的演变是造成武夷湍蛙形成现今格局的重要原因。武夷湍蛙A、B支系的中性检验结果显示,Tajima’s D和Fu’s Fs均为负值,且达到了显著的统计学水平,表明种群历史上可能发生过区域扩增。通过Bayesian skyline plot方法,我们估计武夷湍蛙A支系、B支系分别在25万年前和9.4万年前发生了种群扩张。
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