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SEPT9基因甲基化检测是美国食品药品管理局(Food and Drug Administration,FDA)、欧盟(conformite europeenne,CE)认证和中国食品药品监督管理总局(China Food and Drug Administration,CFDA)批准的用于大肠癌筛查(FDA)和/或早期检测(CE、CFDA)的基因甲基化外周血检测,是世界上第一个获得FDA批准的表观遗传学肿瘤液态活检检测。虽然此检测在大肠癌筛查和早期检测的性能已经得到广泛的验证,但各种影响因素对其性能的影响还未有系统性的研究,其对大肠癌前疾病的检测性能也缺乏足够的数据。本研究旨在探讨患者性别、年龄、癌症分期、癌症部位和算法等因素对此检测性能的影响,并明确此检测对大肠癌前疾病,包括各型腺瘤及息肉的检测性能。本研究以机会性筛查方法共入组428名受试者,其中包括98名大肠癌患者,86名各型腺瘤患者,67名增生性息肉患者和177名无疾病受试者。本研究运用实时荧光定量多聚酶链式反应(qRT-PCR)对SEPT9基因启动子区域的甲基化水平进行检测,试验采用ABI7500 Fast DX荧光定量PCR仪和Epi proColon 2.0 CE试剂盒进行检测。所有血液样品采集、运输、处理、血浆提取、DNA保存、亚硫酸盐转化、PCR、数据分析和判读等操作均遵循Epi proColon 2.0 CE试剂盒说明书进行。统计学分析和制图采用GraphPad PRISM 5.0软件完成。研究结果表明:1/3算法在大肠癌、腺瘤、增生性息肉的阳性检出率(positive detection rate,PDR)均高于2/3算法,然而,其在正常人中的假阳性率也高于2/3算法。不论采取何种算法,SEPT9检测对0期和I期大肠癌的阳性检出率显著低于对II~IV期大肠癌的阳性检出率。然而,SEPT9检测对0期和I期大肠癌的检出率均超过50%,说明其可以应用于大肠早癌筛查。60岁以上正常人群的阳性率显著高于小于60岁的人群,而在小于60岁人群中,SEPT9检测的阳性率随年龄组增高而逐渐递增。与此相对,大肠癌人群的阳性检出率在各年龄组间无显著性差异。进一步研究显示,大肠癌患者的阳性检出率在各大肠癌分期均未显示性别方面的差异,在结直肠各个部位,包括回盲部、升结肠、横结肠、降结肠、乙状结肠、直肠,SEPT9检测的阳性检出率也没有发现显著性差异。针对腺瘤的分型检测显示,若使用1/3算法,锯齿状腺瘤(serrated adenoma,SA)的PDR为27.8%,管状腺瘤(tubular adenoma,TA)的PDR为28.7%,管状绒毛腺瘤(tubulovillous adenoma,TVA)的PDR为53.7%,绒毛状腺瘤(villous adenoma,VA)的PDR为83.3%,表明PDR与腺瘤中绒毛成分的含量呈正相关。对TVA和VA的高阳性检出率说明SEPT9检测可用于癌前进展期腺瘤(advanced adenoma,AA)的筛查。我们的研究说明,算法、癌症分期和受检者年龄对SEPT9检测的性能有影响,而性别和癌症部位对检测性能没有影响。SEPT9检测对含绒毛成分的腺瘤有较高的灵敏度,而对增生性息肉的检出率较低,因此,它可作为进展期腺瘤及早期大肠癌的血液筛查工具。