本文探讨的是在WTO体制内国家主权利益与贸易自由化的冲突与协调问题。本文首先介绍了国家主权的概念和国家主权原则在国际法上的发展和完善。接着笔者引入了国家主权利益这概念并对其下了定义,指出国家主权利益在当代涵盖范围的广泛性并且着重论证了国家主权利益在国际法上的实现。指出国家主权利益是当代国家对外活动的最终动因。笔者认为以贸易自由化为主要内容的WTO体制在本质上是关于利益分配与协调的规则体系,贸易自由化客观上需要主权利益进行让渡,由此与主权利益产生了冲突与矛盾。WTO自由贸易规则迫使主权利益寻求新的隐性保护手段,民族国家都利用WTO规则中的灰色地带获取主权利益的最大化。在新的历史条件下,反倾销和反补贴、技术贸易壁垒、绿色贸易壁垒已成为维护国家主权利益的“三种武器”,并分别介绍了它们的内容和特点。介绍了美国、欧盟、印度的贸易保护主义立法实践。指出在当代贸易自由化的进程中,以保卫国家主权利益中的国家环境利益、公共健康利益为内容的贸易保护主义立法有着更加广阔的发展空间,它是新形势下贸易保护主义的有利理论依据。最后指出我国应该在贸易自由化的进程中进行总结和反思,在借鉴它国经验基础上提出了全面保护我国民族产业的法律意见。