确定一个118kb包含水稻稻瘟病抗性基因Pi-2(t)位点的DNA片段

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稻瘟病是一种由病原菌Pyricularia grisea sacc.引起的真菌性病害,是危害世界水稻生产的主要病害之一.对稻瘟病最有前途的防治途径是培育抗性品种.此前的研究表明,位于水稻第六染色体的一个主效基因Pi-2(t)对稻瘟病具有非常广的抗性.该研究利用一个292个家系的重组自交系群体,结合生物信息学的方法,将Pi-2(t)基因定位于一个SSR(simple sequence repeat)标记SSR140和RFLP(restriction fragment length polymorphism)标记JSH12之间,距离两者均为0.9cM.由此,我们构建了Pi-2(t)位点的物理图谱,它由一个包含6个BAC(bacterial artificial chromosome)克隆的重叠群组成.进一步的重组事件分析将Pi-2(t)基因确定在一个118kb的DNA片段上.利用Genscan软件对序列进行分析,并将预测的基因与数据库中已有基因进行比较,结果显示,此片段包含一个编码激酶的完整开放读码框架.这一特点与以前克隆到的植物抗病基因吻合.我们将该激酶所编码的基因初步确定为Pi-2(t)的侯选基因.该研究完成了Pi-2(t)基因的精细定位和物理图谱,为顺利克隆Pi-2(t)基因打下了基础;同时为利用分子标记辅助选择育种的方法转移Pi-2(t)基因提供了迄今为止最为接近的分子标记.
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