利用笹锦/IRAT10重组自交系群体分析粳稻穗部和叶片性状的QTL

来源 :沈阳农业大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:proshyrain
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水稻穗部性状是理想株型的重要组成部分,发掘和利用新的水稻穗部相关性状的QTL,可为水稻分子育种提供理论参考和基因资源。本试验以优质粳稻笹锦和粳型旱稻IRTA10杂交衍生的234个重组自交系群体为试验材料,通过三年的田间试验,对穗长、枝梗数,总粒数、实粒数、粒长、粒宽、粒厚、剑叶长、剑叶宽等性状进行分析与QTL定位。主要研究结果如下:1.穗部性状的相关性分析表明,穗重与粒厚和长宽比相关性不显著,与穗部其它各性状相关性极显著;穗长对粒长、粒厚、结实率及长宽比影响较小,与其它各性状相关性显著;枝梗数量对粒长、粒宽、长宽比影响较小,与粒厚及其它穗部性状相关性显著;总粒数与实粒数、粒长、粒宽、长宽比相关性不显著,与粒厚等其它性状相关性显著。千粒重与水稻的穗长和结实率相关性不显著,与其他穗部性状相关性显著。2.叶片性状与穗部性状的相关性分析表明,剑叶的长、宽、厚和叶面积与穗重、穗长、枝梗数、每穗总粒数、实粒数、结实率及着粒密度相关性显著,与粒长、粒宽、粒厚、长宽比和千粒重相关性不显著;叶片的叶绿素和类黄酮与千粒重、结实率相关性显著;抽穗期与穗重、粒长相关性不显著,与其它性状相关性显著。3.利用ICI Mapping软件对水稻穗部性状和叶片性状进行定位,共检测到QTL位点107个,分布于水稻的12条染色体上,其中主效QTL 15个,单个贡献率介于16.39%~45.19%之间,包含控制穗重、穗长、一次枝梗数、实粒数、粒长、粒宽、粒厚、千粒重和粒长宽比的QTL。同一性状三年间在相同区间重复检测到的QTL有22个,分布在第1、2、3、4、5、8、10和12号染色体上。第1、8和10号染色体上所定位重复检测到的QTL,可能是新的QTL,暂未发现克隆基因QTL。4.对试验中所定位到的QTL位点进一步分析,发现这些QTL有7个热点区域。第1号染色体的RM5336-RM1195区间,检测到控制穗部及叶片性状的QTL 8个;位于第2号染色体的RM1358-RM492标记区间,检测到控制穗部性状的QTL 8个;第3号染色体上,在区间RM231-STS8检测到QTL 9个,在区间RM4992-RM3417检测到QTL 8个,在区间RM1940-RM2334检测到QTL 7个,成簇现象在第3号染色体上分布明显,位于第3号染色上体控制水稻农艺性状的热点区域覆盖范围较大。在第8号染色体的标记RM3395附近检测到控制千粒重、粒长、总粒数等5个QTL;在12号染色体STS19标记附近也存在多个控制水稻各性状QTL。对于染色体上QTL位点成簇分布的的现象,其原因可能为基因的一因多效所引起的,或为基因的重叠及紧密连锁现象。
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