原发性肝细胞癌中JAK1基因的突变分析

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为了分析和探讨JAK1基因的改变与肝细胞癌发生的关系,本研究采用常规苯酚—氯仿方法提取肝癌细胞和同一患者正常肝细胞基因组DNA。经过对JAK1基因有报道可能突变的12个外显子进行引物设计后,经聚合酶链反应(PCR)分别扩增,引物设计在内含子中以确保扩增片段包含整个外显子和内含子与外显子的剪接位点。所得PCR产物经加热变性为单链,于聚丙烯胺凝胶中电泳,进行单链构象多态性分析(Single strand conformational polymorphism,SSCP),经放射自显影观察。最后将PCR-SSCP发现有异常的PCR产物扩增纯化后进行DNA序列测定,确定碱基改变类型。实验以正常肝细胞DNA最为对照。结果显示:在12个肝癌细胞系中没有发现突变基因,而发现在编号为#33的病例肿瘤样品DNA对此野生型DNA样品表现出异常条带。对其测序证实,该病例在外显子13上发生了两个碱基的改变:2008G>T,Q646V;2009G>T,H647F。同时我们也发现JAK1基因外显子14的单核苷酸多态性现象(Single nucleotidepolymorphism;SNP)的高发频率现象(14%)。由此可以认为,由于JAK1的突变频率为1.2%,比较低,因此并不能确定,JAK1基因的突变与肝癌发生的关系,该研究也发现SNP的发生率较高,并且有趣的是,编号为#2和#148的样品同时在外显子5和外显子10上都有SNP现象。这可能与肝癌的发生有一定的联系,进一步的研究或许能揭开其中的机制。
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