水利是农业的命脉,农村水利基础设施是农业生产和经营活动的重要保障。税费改革以来,农村水利产权制度改革取得了一定的成效,但并未对跨区域水利基础设施进行研究,随着区域经济的发展,跨区域农村水利设施的建设问题也随之凸现出来,尤其是跨区域河流上的水利基础设施。由于跨区域农村水利基础设施产权不清晰和跨区域特点,导致“搭便车”和机会主义行为频繁发生、管理与维护体制不完善、供给主体混乱缺失、水利设施功能急剧退化等区域负外部性产生,如果不及时对农村水利基础设施的现状进行改革,不仅影响农村的生产生活,还对整个社会的经济发展形成障碍。跨区域水利基础设施区域外部性产生的原因有：第一,农村水利设施的公共产品属性,产权模糊,管理供给机制缺失；第二,我国现有的行政区域划分,区域之间为竞争关系,各区域设施区域壁垒与障碍使本区域利益最大化；第三,我国当前以GDP为核心的官员政绩考核机制,致使区域主体只关注水利基础设施的前期修建,忽略了水利基础设施后期的运行与管理维护。农村水利基础设施属于公共产品范畴,本文在研究公共产品外部性理论的基础上,对水利基础设施的跨区域外部性产生的原因、类型、影响与后果进行分析,重点分析了区域负外部性的影响。并以河北省石家庄市境内的滹沱河上的岗南水库和黄壁庄水库为例进行实证研究,分析了两大水库对处于河流上游的石家庄市和下游衡水市的区域外部性影响,利用数据包络分析方法(DEA)建立水库的跨区域外部性测量与评估模型,首先证明了水利基础设施跨区域外部性的存在；其次,对外部性影响大小进行了测量评估；最后,对农村水利基础设施产权制度创新和政府政策措施建议进行改革,得出区域负外部性内部化机制与具体举措。通过对跨区域农村水利基础设施建立共有产权、明晰产权主体和设立农户水利协会等共同管理机构等产权制度改革,形成合理的水权交易和水价改革机制,并加以政府政策措施建议的辅助,减少或内化区域负外部性,使跨区域水利基础设施功能充分发挥和良好运行,促进区域经济协调发展。