改革开放以来,随着人民生活水平的提高和对医疗保健需求的不断增长,制药行业一直保持着较快的发展速度。进入21世纪后,中国的经济正在实现新的腾飞,与之相伴,制药企业间的竞争日趋激烈。我国制药企业要想提升核心竞争力,在全球市场竞争中占有一席之地,就必须将企业的战略与绩效管理有机的结合起来,让组织的发展、员工的工作朝着实现战略目标的方向发展,使企业的成长进入一个良性的循环。但是,目前我国的制药企业,与国际大型制药企业相比,在绩效管理方面仍相对落后,大部分沿用以财务指标为导向的绩效考核和以“德能勤绩”为特征的人事考核,并没有将企业的战略转化为一系列行之有效的绩效管理指标,制约了企业的快速、健康、可持续的发展。为了克服这一困难,本文将借助平衡计分卡这一优秀的管理工具,通过文献研究、问卷调查等方法,来探索制药企业战略绩效管理指标体系的构建。本文首先引入了平衡计分卡这一战略绩效评价工具,其核心思想是通过平衡企业在财务、客户、内部运营和学习与成长这四个维度的目标,设置科学合理的绩效管理指标,使企业各方利益相关者的效用最大化,实现组织和员工的共同发展。其次,由于目前的理论研究当中,将平衡计分卡与我国中小型制药企业相结合的研究并不多见,本文针对我国制药行业的现状和特征,提出了制药企业平衡计分卡的设计思想,并借助战略地图、因果关系链分析等工具,对平衡计分卡在中小型制药企业中的应用进行了分析,继而提出了构建基于平衡计分卡的制药企业战略绩效管理指标体系的设想。最后,以达仁堂京万红药业有限公司为实证研究对象,探索了制药企业将平衡计分卡引入绩效管理的有效途径,通过战略绩效评价指标体系的建立,将企业的战略转化为可以衡量的依据,并运用层次分析法对各指标的权重进行分配,分清工作目标的先后次序、轻重缓急,最终对京万红药业引入平衡计分卡提出建议和对策,即：提升高层管理者对平衡计分卡的理解和认识,重塑企业文化,构建畅通无阻的沟通渠道；建立平衡计分卡团队,将平衡计分卡转化为企业的一种内生制度,长期有效的实施下去。