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甲肝病毒是小核糖核酸病毒科肝病毒属的唯一成员，有着独特的生物学特性。甲肝病毒一般不引起宿主细胞病变，生长缓慢，周期长，最佳产毒培养时间需3至4周，病毒产量不高。这使得对感染性甲肝病毒的检测和滴定变得十分困难和复杂，目前尚没有建立快速的方法。介导蛋白翻译起始的甲肝病毒内部核糖体进入位点（Internal ribosome entry sites；IRES）的结构和功能也与众不同，被单独划归一类。本研究对检测感染性甲肝病毒快速方法的建立和用异源IRES或5’非编码区替换甲肝病毒相应顺式作用元件的可行性进行了探索。 我们提出了通过检测病毒复制时出现的标志物负链RNA中间体来判断感染性病毒存在的新思路，建立了一种快速、特异性地检测感染性甲肝病毒的新方法，即细胞培养／链特异性逆转录聚合酶链式反应法（Integrated cell culture／strand-specific transcriptase-polymerase chain reaction；链特异性ICC／RT-PCR），其技术路线为病毒经细胞培养后，用链特异性RT-PCR检测负链RNA，以判定感染性甲肝病毒的存在。链特异性ICC／RT-PCR法结合了细胞培养法与分子生物学方法特点，可区分感染性病毒和失活病毒，可将感染性甲肝病毒的检测时间由细胞培养法的3至4周减少到1周左右。该法对感染性病毒有着较好的特异性，滴度为107.0TCID50／ml的甲肝病毒经灭活后未产生假阳性结果；该法有着较高的灵敏度，可经细胞培养84小时后检测到模拟水样中滴度为100TCID50／ml的感染性甲肝病毒。在用该法检测活疫苗样品Ref的感染性滴度时，培养时间为5天的结果为107.83 TCID50／ml，培养时间为8天的结果为108.0TCID50／ml，与目前常用ELISA法的检测结果(107.67 TCID50／ml)相近。链特异性ICC／RT-PCR法可应用于食品、水与环境病毒安全性的监测，活疫苗感染性滴度的检测和甲型肝炎的分子流行病学研究，也可应用于灭活疫苗的灭活效力与食品、水中对甲肝病毒或肠道病毒消毒效果的评估。原则上，使用相应的引物，链特异ICC／RT-PCR法可用于检测其它感染性小核糖核酸病毒。