快速发展的细菌抗生素耐药,导致细菌感染临床治疗成为当今严重问题,在新抗生素研发越来越困难的背景下,抗生素耐药研究具有重要理论意义与应用价值。耐药外排泵作为细菌抗生素耐药的第一道防线,其重要性不可忽视。通过全基因组水平的比较分析发现,从不耐药的耻垢分枝杆菌发展到天然多耐药的脓肿,再到多重耐药的结核分枝杆菌的过程中,转运蛋白总数呈现快速减少。一方面,ABC家族成员数量在转运蛋白总数中比例始终稳定在50%左右,另一方面,外排泵（含NBD结构域）在ABC家族中的占比,脓肿与结核分枝杆菌分别为28.0%和29.5%,比耻垢（20.1%）高近10%。相关变化规律暗示了ABC及各亚家族在寄生生活方式、耐药等方面功能相关性。基于NBD结构域的脓肿、结核系统发生树显示:其中有三簇为脓肿和结核高度同源簇,几乎所有结核基因都位于这三簇中。另外还有三簇为脓肿基因所特有。结合进化树的特点,我们随机挑选了8个耐药候选基因进行进一步验证。头孢西丁和氯化铬处理对其中8个耐药候选基因的基因转录水平变化分析发现,耐药株（A173临床分离株）相关基因上调幅度远高于敏感株（标准菌株ATCC19977）;8个基因中,MAB₂622c和MAB₁858对头孢西丁的响应远高于氯化铬。其中MAB₂622c,在头孢西丁处理6小时后,耐药株中基因的表达量显著增加10.78倍（P<0.01）,而敏感株中其表达量未发生显著改变。与氯化铬处理相比,头孢西丁诱导MAB₂622c表达上调是氯化铬2.71倍。我们将A173菌株中的MAB₂622c在耻垢分枝杆菌和标准菌株ATCC19977中过表达发现。在耻垢分枝杆菌中,与野生型和空载体对照组相比,过表达MAB₂622c的菌株对头孢西丁抑菌圈发生显著的减小（P<0.05）。MIC值相较于两组对照组增加了1倍。在ATCC19977中,相较于对照组,过表达MAB₂622c的菌株对头孢西丁的MIC值并未发生改变,但对克拉霉素的MIC值相较于对照组增加了1倍。此外,在A173、A206及A244三株临床菌株中,A173、A206有DNA硫修饰的现象,并在其基因组中发现了Dnd硫修饰基因簇。本研究通过对脓肿分枝杆菌ABC家族耐药外排泵基因组水平研究,发现并初步确定了MAB₂622c等耐药外排泵,为后续耐药机制打下了基础。