肝脏具有许多重要的功能,如合成、解毒和代谢等。肝脏具有独特的再生能力,在物理、化学、生物等因素的诱导下,残肝细胞迅速活化,进入细胞周期和细胞增殖的过程以补偿丢失的肝组织并恢复肝脏的生物学功能,此过程称为肝再生(liver regeneration,LR)。肝脏再生是一个由多种因素共同调节控制的复杂精密过程,由多细胞和多因子参与,涉及多种生理生化活动。本文从调节组学出发,探究大鼠肝再生中基因甲基化、miRNA、lncRNA、circRNA、蛋白磷酸化、蛋白乙酰化、蛋白糖基化、蛋白泛素化等调控方式对基因转录活动的调节作用以及它们对肝再生进程的影响,进一步阐明大鼠肝再生的分子机理。本研究以SD大鼠的2/3肝切除作为模型,通过高通量测序得到大鼠肝再生中基因甲基化、miRNA、lncRNA、circRNA、蛋白磷酸化、蛋白乙酰化、蛋白糖基化、蛋白泛素化等调控方式涉及的基因/RNA/蛋白的种类及表达变化,用GO、NCBI和IPA等网站和软件确定与基因转录活动相关的基因/RNA/蛋白,生物统计和计算机分析等得到其ratio值进而筛选出差异基因/RNA/蛋白,系统生物学等方法分析它们在大鼠肝再生基因转录活动中的作用。结果表明,大鼠肝再生中基因转录活动:(1)涉及甲基化基因307种,其中,转录起始、转录延伸、转录终止和转录后修饰的甲基化基因数依序为106、23、28和66;(2)涉及230种miRNA,其中,转录起始、转录延伸、转录终止和转录后修饰的miRNA数依序为196、19、33和138;(3)涉及271种lncRNA,其中,转录起始、转录延伸、转录终止和转录后修饰的lncRNA数依序为207、16、0和188;(4)涉及195种circRNA,其中,转录起始、转录延伸、转录终止和转录后修饰的circRNA数依序为195、124、152和193;(5)发生磷酸化修饰的蛋白57种,其中,转录起始、转录延伸、转录终止和转录后修饰的磷酸化蛋白数依序为18、13、18和17;(6)发生乙酰化修饰的蛋白37种,其中,转录起始、转录延伸、转录终止和转录后修饰的乙酰化蛋白数依序为12、2、4和12;(7)发生糖基化修饰的蛋白10种,其中,转录起始、转录延伸、转录终止和转录后修饰的糖基化蛋白数依序为3、0、0和3;(8)发生泛素化修饰的蛋白49种,其中,转录起始、转录延伸、转录终止和转录后修饰的糖基化蛋白数依序为13、6、5和6;(9)各调节方式涉及的大鼠肝再生相关mRNA有234种,蛋白64种。