我国每年大学生毕业的人数逐年快速增加,2008年全国普通高校毕业生达559万,比2007年增加64万,增幅13%；2009年全国普通高校毕业生达610万,比2008年增加51万,增幅9.1%,就业形势日趋严峻,大部分领域已出现了“就业难”的问题。在全国就业形势不容乐观的情况下,独立学院毕业生开始大量走向人才市场,中医院校独立学院因此面临着巨大的就业压力。以湖南中医药大学湘杏学院的毕业生为研究对象,分别就所学专业与所从事工作相关性、所学专业知识、技能在工作中的适用程度、工作中所需专业知识、技能的培养环节及制约我院毕业生就业的最大障碍等问题进行问卷调查,经分析发现专业知识、技能不够扎实和没能形成合理的知识结构直接影响着毕业生的就业,专业设置与就业密切相关。但是,中医院校独立学院专业设置问题明显,集中体现在：独立学院依托母体高校的优势学科重复设置专业,各中医院校独立学院之间专业雷同性强,母体高校与独立学院之间课程设置雷同。因此,要解决就业难问题,首先要解决专业设置问题。以就业为导向的专业设置对策主要有：搭建人才供需信息平台,依据人才市场预测结果,不断修正中医院校独立学院的专业设置；根据人才市场需要调整课程设置；引入通识教育的理念加强专业建设；以专业方向为基础发展以就业为导向的新专业；以就业为导向,不断拓展新专业。此研究为中医院校独立学院专业设置改革和可持续健康发展提供了科学依据。