碳水化合物结合结构域—PET水解酶融合蛋白的构建与动力学模拟

来源 :吉林大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:2034912
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
大量塑料制品被使用后丢弃或进入垃圾填埋场,最终流入自然环境中,已经造成了严重的环境污染问题。聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)作为使用最广泛的塑料之一,由于其降解困难,已有的回收方法都不能实现PET的绿色高效回收再利用。PET水解酶介导的PET生物降解由于无污染、条件温和的优势,近年来受到人们的广泛关注。然而,目前已知的PET水解酶催化效率过低,无法满足实际需求,因此,急需开发新型高效的PET水解酶来解决日益严重的PET污染问题。PET水解酶催化效率低下的原因之一是酶分子与PET膜结合能力差,而多种碳水化合物结合结构域(CBM)已被证实能够与PET膜结合。因此,构建CBM与PET水解酶的融合蛋白,有望增强酶与PET的结合能力,进而提升酶分子对PET的降解能力。但由于CBM与PET膜结合的机制目前尚不明确,从庞大的家族中筛选出合适的CBM十分困难。基于上述考虑,本研究以PET水解酶中效率较高的叶枝堆肥角质酶(LCC)作为研究对象,定点突变获得了四突变体ICCG(F243I/D238C/S283C/Y127G);筛选获得4个不同来源的CBM,并与ICCG构建了相应的融合蛋白,最后通过分子动力学模拟对CBM与PET可能的结合位点和机制进行了系统探究。结果表明:角质酶LCC的最适p H为9.0,最适温度温度为50℃,具有良好的热稳定性;突变体ICCG最适p H同样为9.0,最适温度提升至60℃,略高于LCC,表明ICCG热稳定性更为突出;同时,根据反应后PET表面形貌的扫描电镜分析显示,ICCG对PET膜的降解能力显著优于LCC。接着,筛选获得了4个不同来源的CBM,构建了CBM与ICCG的融合蛋白。以PET四聚体为配体,分别与4个CBM进行分子对接,并根据分子对接的结果选择合适的位置为初始构象进行分子动力学模拟,结果表明,筛选出的4个CBM均具有与PET结合的潜力,有望提升融合蛋白对PET的降解能力。最后,通过结合自由能计算和能量分解,得到4个CBM与PET结合时各自的关键性残基以及残基与PET分子间主要的相互作用,总结4个CBM与PET结合的异同点可知,CBM与PET的结合过程中,范德华相互作用是主要驱动力,侧链带有环状结构的氨基酸可能发挥着重要作用,环状结构的分布和取向,影响对CBM与PET的结合能力;侧链带正电的精氨酸也可能对结合有促进作用。综上,本研究筛选并构建显著提升PET降解能力的CBM-PET水解酶融合蛋白,为高效PET水解酶的理性设计及PET分子的降解与循环再利用提供了良好的思路。然而,由于长春新冠疫情的影响,本研究未能完成融合蛋白降解活性的检测,后续将系统评价融合蛋白PET水解活性,并基于计算机辅助设计与理性设计构建催化能力更为优良的PET水解酶分子。
其他文献
双柱锻造液压机以效率高、机械化程度高、节能节材效果显著等特点,已成为自由锻造设备中的主要发展方向。工作缸作为液压机的主要受力原件,应用中会出现柱塞拉伤、导向套磨损和密封结构破坏等问题,对设备的正常运行造成了严重影响。双柱锻造液压机工作缸与活动横梁之间的连接方式有刚性连接、单球铰连接和双球铰连接三种形式,其中球铰连接方式被广泛应用于现有设备中。与刚性连接方式相比,球铰连接有效地降低了导向套和密封的更
钢结构直接分析设计法是《钢结构设计标准》修订时所最新引入的内容,为保持教学内容的先进性及与现行设计标准有效衔接,理应将其纳入“钢结构设计原理”课程教学。在分析直接分析设计法教学重点及难点的基础上,探讨了应用有限元软件NIDA辅助进行直接分析设计法可视化讲解的方法。实践表明,将NIDA软件应用到钢结构直接分析设计法的可视化教学中,不仅可有效增强学生在课程教学中的参与感,激发学习兴趣,深化基本概念的理
在建设海洋强国的时代背景下,结合专业课程群和虚拟仿真实验的教学团队建设,能够进一步推动高质量专业人才培养。以物理海洋学课程群为基础,结合虚拟仿真实验,探索新的人才培养模式。经过建设,在教学方法、专业知识和技能、课程思政等方面都有良好的成效。
背景 白色脂肪棕色化是目前代谢性疾病研究的热点,肌肉生长抑制素(Mstn)不仅可负向调控肌肉生长,还与脂肪细胞生长、分化有关,但Mstn对2型糖尿病(T2DM)白色脂肪棕色化的影响尚不明确。目的 观察Mstn基因敲除的T2DM小鼠白色脂肪棕色化相关基因表达变化,探究Mstn对T2DM小鼠白色脂肪棕色化的影响。方法 2019年1月至2020年1月,将12只野生型(WT)、12只杂合型Mstn基因敲除
本文介绍了一种客观、由数据驱动的桥梁性能评估方法,来识别结构损伤,用于构建桥梁监测的系统。通过桥梁上的传感器来收集数据,捕捉整个结构中载荷的分布。ANN用于确定在交通事件期间,桥上的若干传感器位置处测量的范围变化关系,来建立桥梁状态模型,并评估桥梁的损伤状态。
<正>教育部公布了第二批“全国高校黄大年式教师团队”名单,柳铁职院自动控制学院以全国优秀教师、第六届黄炎培职业教育杰出教师奖黄莺教授为负责人的“高铁信号职教装备开发教师团队”成功入选,实现了学校国家级“黄大年式教师团队”零的突破,是广西高职院校唯一入选团队。这是长期以来学校坚持党管人才、强化资队伍建设的有力见证。
期刊
《中华人民共和国个人信息保护法》对个人信息保护提出了新的、严格的规定,卫生健康行业在个人信息保护工作中面临一系列挑战与问题,要将《中华人民共和国个人信息保护法》与《中华人民共和国网络安全法》《中华人民共和国数据安全法》作为实现个人信息保护的整体法律指引,借鉴其他国家或地区成熟的经验与做法,在国家卫生行政主管部门的组织下,研究符合卫生健康行业的行政法规或实施细则,细化对行业指导,加强监管,提升行业专
<正>关于晶胞的计算是历年高考、竞赛、自主招生考试的难点,本文结合具体实例,针对考生常常遇到的一些解题难点做出归纳分析.一、晶体或晶胞中粒子个数、化学式或某些化合价的推断推算晶体或晶胞中粒子个数、化学式或某些化合价,常常需要使用"均摊法"、"分割法","均摊法"
期刊
为帮助大学生树立正确的生命观,政府要加强大学生生命教育相关政策的引导与支持,高校要培养高素质的生命教育师资队伍,家庭要塑造积极上进的生命教育环境,大学生要发挥生命教育中自我教育功能。政府、学校、家庭和学生协同进行“四体一体”的大学生生命教育建设,可以助推大学生生命教育实效性的发挥。