建设工程项目管理是指从项目前期阶段开始经过项目实施阶段到完成项目后评估,通过项目选择和项目系统化实施,使得项目的最终目标有效完成的过程。建筑施工企业是工程项目建设过程中人力、物力、财力、技术、信息各种资源的总汇集者,也是工程项目建设过程的总策划者和最终实现者,承担着总组织的责任,所以建筑施工企业是建设工程项目各参与方中最重要的一方,建筑施工企业项目管理是一个具体工程项目管理实施的核心。建筑施工企业项目管理主要特点就是运用项目管理理论对工程项目进行全方位全过程系统化、运营化的主动控制、动态控制的组织协调控制管理。本文以S公司的项目管理为研究对象,通过S公司项目管理的现状、存在的问题和问题根源剖析,提出当前适合S公司项目管理的系统化方法。通过前期S公司的项目管理方法与现在S公司的系统化项目管理方法的比较,突出S公司项目管理系统化思维方法的4个方面的改进,项目管理信息化、风险把控全程化、组织架构再设计、项目管理运营化。结合实例通过S公司M项目的初步改进性研究,探索出一条S公司项目管理问题初步解决的新路径,希望能够增加项目管理的有效性,以提高我国建筑施工企业项目管理水平。在本文中通过重点阐述项目管理系统化概念和项目选择体系、项目管理后评估体系的建立,根据当前S公司M项目的管理现状提出了多项目运营官岗位的设置方案和和谐体利益最大化理论,希望能够为培养可持续性发展的专业技术和管理复合型项目管理队伍,为项目系统化运营化理论的落地,为项目管理组织架构的重新设计提供新的思路。