基因和环境都会影响一个人的患病风险。尽管基因经常被分类、干扰、激活、沉默,但是依旧不可忽视对环境暴露的相关研究。环境暴露是指化学、生物、物理因子在特定的时间和空间发生的和身体的接触。以往研究发现,基因突变解释了约10-15%的帕金森病（PD）发病机制,而大多数PD病例的主要诱因是环境暴露。环境暴露会引发机体的线粒体功能障碍。线粒体功能障碍是诱发多巴胺能神经元变性的常见途径,这证明线粒体功能障碍是诱发帕金森病的关键,但其潜在的机制仍不清楚。在第一章节的研究中,我们通过高通量测序的方法,证明神经毒素暴露或基因突变可能共同作用,使H3.2变体（H3.2 K27ac）赖氨酸27乙酰化增加,通过H3K27高乙酰化激活该区域的活性增强子活性,造成线粒体功能障碍,从而导致转录组改变,诱发疾病。我们通过鱼藤酮（Rotenone）环境暴露和TFAM基因敲除分别处理N27细胞,并从Ch IPseq和RNA-seq测序数据发现,两组处理中上调和下降的基因分别有509和619个基因是共享的,并大多集中在转录调控,信号传导等生物学通路上。通过整合RNA-seq和Ch IP-seq数据,我们还发现在线粒体损伤的N27细胞中,H3K27ac增加与促进转录明显正相关。在挑选的几个基因组位点,显示H3K27ac的变化和转录变化一致,说明对我们的线粒体损伤模型诱导的m RNA表达水平对H3K27ac修饰变化极为敏感。并通过motif分析,成功的预测了多个候选的转录因子,为后期的进一步实验验证和机制研究指明了方向。在第二章节的研究中,我们通过采用小鼠胚胎干细胞模型,探讨高、低剂量的BPA暴露处理对细胞增殖的影响以及具体影响的生物学通路。我们证实在低剂量BPA暴露组中,主要影响中间纤维生物学过程,神经系统发育、细胞分化、离子转运、多细胞生物发育和细胞-细胞信号转导,囊泡运输等通路。在高剂量BPA处理组中,则主要集中在离子转运,黏蛋白连接,突触功能、轴突功能,Pol II结合等。通过高通量测序的方式及多种交叉手段为BPA暴露下的干细胞增殖研究提供更有力的证据。