论文部分内容阅读
内质网(Endoplasmic reticulum,ER)是真核细胞内蛋白质、脂类和糖类等生物大分子合成的基地。外界条件干扰导致内质网不能发挥正常的生理功能,使错误折叠或未折叠蛋白在内质网上堆积,引起内质网应激(Endoplasmic reticulum stress,ERS),激活未折叠蛋白反应(Unfolded protein reaction,UPR)应对ERS,以恢复内质网稳态。由ERS引起的UPR与人类的疾病密切相关。它与肿瘤耐药性的产生,糖尿病、心血管和呼吸道等疾病的发病机制有复杂的联系。因而,UPR调控机制的研究对药物研发、抗药性研究有着重要意义。
在酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)中,UPR仅有保守的一条通路,即IRE1/HAC1通路。未折叠蛋白聚积激活内质网驻留蛋白IRE1,导致IRE1寡聚化并自磷酸化,进而激活其核酸内切酶活性。IRE1的活性形式剪接HAC1的前体mRNA(HAC1u)以产生可翻译的mRNA(HAC1s),剪接后的HAC1mRNA翻译成蛋白并调控下游靶基因的转录。
在野生型菌株(BY4741)及两种缺失突变体(ire1Δ和ire1Δhac1Δ)中对酿酒酵母必需基因高表达库进行筛选,寻找IRE1以外的UPR调控通路。结果发现了6个在不同的基因型背景下的DTT(二硫苏糖醇,一个典型的UPR诱导剂)耐受性基因,按功能分为三类核糖体组成(NSA2)、蛋白质合成调控(CBK1、SEC61)和mRNA加工(PRP5、HSH155、PRP16)。其中,PRP16能弥补DTT对ire1Δ造成的生长抑制,而对野生型菌株(BY4741)和ire1Δhac1Δ没有明显的回补效果,所以由这个基因介导的ERS抗性依赖于HAC1,但独立于IRE1。
PRP16具有ATP依赖性的RNA解旋酶活性,参与前体mRNA剪接的第二步骤。研究发现,PRP16上调HAC1转录抵抗DTT引起的内质网应激,但不能弥补ire1Δ中剪接功能,所以尽管PRP16能诱导野生型菌株中的组成型UPR,但是产生功能性的HAC1s mRNA不是PRP16提高ire1Δ对DTT的抗性的原因。进一步研究发现,PRP16介导的DTT耐受性依赖于HAC1u而非HAC1s。HAC1u可以通过调控UPR靶基因的表达能发挥转录因子的作用抵抗内质网应激,并且它的第一个外显子是它发挥作用的关键部分。还探究了HAC1s和HAC1u在调控UPR靶基因转录水平的差异,结果表明HAC1s能上调大部分UPR靶基因,但HAC1u仅能调控约四分之一的UPR靶基因,这些被上调的基因涉及到蛋白折叠、糖基化修饰、蛋白分选、囊泡运输等生物过程。
最后,探讨了HAC1在真菌和哺乳动物中的保守性。在白色念珠菌(Candida albicans)中,HAC1保守性高,过表达C.a.HAC1u具有酿酒酵母HAC1u相同的表型。但是XBP1(哺乳动物中与HAC1同源的基因)的保守性低,酵母细胞过表达XBP1对DTT导致的ire1Δhac1Δ生长抑制有轻微的回补作用,但其表型与HAC1并不完全相同,这可能是因为哺乳动物中mRNA的修饰或翻译后修饰机制不同。
总之,我们的研究筛选出了一系列DTT耐受性基因,并研究了其中的PRP16的抗ERS的机制。我们的结果表明,PRP16依赖HAC1u上调一部分UPR靶基因,以抵抗ERS,并且这一机制具有真核生物的保守性。
在酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)中,UPR仅有保守的一条通路,即IRE1/HAC1通路。未折叠蛋白聚积激活内质网驻留蛋白IRE1,导致IRE1寡聚化并自磷酸化,进而激活其核酸内切酶活性。IRE1的活性形式剪接HAC1的前体mRNA(HAC1u)以产生可翻译的mRNA(HAC1s),剪接后的HAC1mRNA翻译成蛋白并调控下游靶基因的转录。
在野生型菌株(BY4741)及两种缺失突变体(ire1Δ和ire1Δhac1Δ)中对酿酒酵母必需基因高表达库进行筛选,寻找IRE1以外的UPR调控通路。结果发现了6个在不同的基因型背景下的DTT(二硫苏糖醇,一个典型的UPR诱导剂)耐受性基因,按功能分为三类核糖体组成(NSA2)、蛋白质合成调控(CBK1、SEC61)和mRNA加工(PRP5、HSH155、PRP16)。其中,PRP16能弥补DTT对ire1Δ造成的生长抑制,而对野生型菌株(BY4741)和ire1Δhac1Δ没有明显的回补效果,所以由这个基因介导的ERS抗性依赖于HAC1,但独立于IRE1。
PRP16具有ATP依赖性的RNA解旋酶活性,参与前体mRNA剪接的第二步骤。研究发现,PRP16上调HAC1转录抵抗DTT引起的内质网应激,但不能弥补ire1Δ中剪接功能,所以尽管PRP16能诱导野生型菌株中的组成型UPR,但是产生功能性的HAC1s mRNA不是PRP16提高ire1Δ对DTT的抗性的原因。进一步研究发现,PRP16介导的DTT耐受性依赖于HAC1u而非HAC1s。HAC1u可以通过调控UPR靶基因的表达能发挥转录因子的作用抵抗内质网应激,并且它的第一个外显子是它发挥作用的关键部分。还探究了HAC1s和HAC1u在调控UPR靶基因转录水平的差异,结果表明HAC1s能上调大部分UPR靶基因,但HAC1u仅能调控约四分之一的UPR靶基因,这些被上调的基因涉及到蛋白折叠、糖基化修饰、蛋白分选、囊泡运输等生物过程。
最后,探讨了HAC1在真菌和哺乳动物中的保守性。在白色念珠菌(Candida albicans)中,HAC1保守性高,过表达C.a.HAC1u具有酿酒酵母HAC1u相同的表型。但是XBP1(哺乳动物中与HAC1同源的基因)的保守性低,酵母细胞过表达XBP1对DTT导致的ire1Δhac1Δ生长抑制有轻微的回补作用,但其表型与HAC1并不完全相同,这可能是因为哺乳动物中mRNA的修饰或翻译后修饰机制不同。
总之,我们的研究筛选出了一系列DTT耐受性基因,并研究了其中的PRP16的抗ERS的机制。我们的结果表明,PRP16依赖HAC1u上调一部分UPR靶基因,以抵抗ERS,并且这一机制具有真核生物的保守性。