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目的评估两种分子生物学诊断技术利福平耐药结核分枝杆菌实时荧光定量核酸扩增检测技术(Gene Xpert MTB/RIF,简称“Gene Xpert”)和基因芯片技术(简称“芯片法”)联合应用在快速诊断涂阴肺结核患者中的临床应用价值。方法纳入2018年8月-2019年11月重庆医科大学附属第一医院结核病区痰涂片阴性且同时送检了改良罗氏培养法(简称“培养法”)、Gene Xpert及芯片法检测分枝杆菌的疑似肺结核患者117例。计算并比较三种独立方法及两种分子生物学方法联合应用(简称“联合应用”,Gene Xpert或芯片法任一阳性,联合应用结果判定为阳性)检测结核分枝杆菌(MTB)的阳性率;分别以培养法、临床最终诊断为标准,计算并比较培养法、Gene Xpert、芯片法及联合应用四种方法诊断涂阴肺结核的敏感度、特异度、准确度、阳性预测值、阴性预测值以及一致性。同时对三种独立方法检测均阳性的标本进行药物敏感试验(DST),以培养法DST为标准,评价两种分子生物学方法对早期诊断耐药结核病的效能。率的比较采用χ~2检验进行差异性分析,一致性分析采用Kappa检验。结果(1)临床诊断肺结核患者76例,非结核患者41例。培养法、Gene Xpert、芯片法及联合应用检测MTB阳性率分别为29.1%、39.3%、32.5%、46.2%,联合应用阳性率最高,与三种检测方法相比差异均具有统计学意义。(2)以培养法为标准:Gene Xpert、芯片法、联合应用检测MTB的灵敏度分别为79.41%、76.41%、91.18%,特异度分别为77.11%、85.54%、72.29%,准确度分别为77.78%、82.91%、77.88%,阳性预测值分别为58.70%、68.42%、57.40%,阴性预测值分别为90.10%、89.87%、95.24%,联合应用与培养法具有中等一致性(Kappa=0.541,P<0.05)。(3)以临床最终诊断为标准:培养法、Gene Xpert、芯片法、联合应用检测MTB的灵敏度分别为44.74%、56.58%、50.00%、77.11%,特异度分别为100.0%、92.68%、100.0%、92.68%,准确度分别为64.1%、69.23%、67.52%、76.07%,阳性预测值分别为100.0%、93.43%、100.0%、94.44%,阴性预测值分别为49.40%、53.52%、51.90%、60.32%,联合应用提高了诊断价值,与临床最终诊断一致性最好(Kappa=0.532,p<0.05)。(4)33例标本同时进行传统、Gene Xpert、芯片法的耐药性检测,共发现4例(4/33,12.12%)耐药结核病,其中3例为耐多药结核病(MDR-TB),1例为单耐异烟肼结核病(HR-TB),Gene Xpert及芯片法与传统DST检测结果一致,诊断价值均较好。结论(1)两种分子生物学方法联合应用提高了涂阴肺结核中检测MTB的阳性率,且能快速得出结果,检测效能提高,可作为标本获取困难或重症涂阴患者的快速诊断手段,尤其对重症患者更有早期诊断价值。(2)两种分子生物学方法均可作为耐药结核病的有效诊断方法。