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目的:利用人类全基因组表达谱芯片,研究维吾尔族妇女宫颈癌及癌前病变组织特异性差异表达基因谱,筛选下调表达候选基因,定量检测候选基因的特异性和灵敏度,建立宫颈癌的早期预警指标。方法:收集维吾尔族妇女宫颈病变新鲜组织标本 72 例,其中宫颈鳞癌(cervical squamous cell carcinoma,CSCC)25 例,宫颈内上皮瘤变(cervical intraepithelial neoplasia,CIN)22 例,宫颈炎或正常宫颈组织(normal cervix,NC)25例。利用20例高质量组织标本(CSCC 7例,CINIII 6例,NC 7例),提取组织RNA,通过人类全基因组表达谱芯片筛查及生物信息学分析,筛选宫颈癌及癌前病变(CIN)特异性下调表达基因。选取四种候选基因,设计mRNA序列特异性引物,利用半定量RT-PCR方法,对72例宫颈病变组织RNA进行候选基因转录表达水平鉴定,经统计学分析,评价候选基因的表达水平差异。为了进一步验证半定量RT-PCR数据,设计四种候选基因的定量PCR引物,对宫颈病变组织RNA进行候选基因表达水平的荧光定量RT-PCR分析,明确具有显著差异的下调表达基因,评价其特异性和灵敏度。结果:通过20例宫颈病变组织RNA的人类全基因组表达谱芯片分析,以大于2倍的基因表达差异为量化标准,CSCC与NC相比较,有86种下调表达基因,CSCC与CINIII相比较,有23种下调表达基因,而CINIII与NC相比较,只有3种下调表达基因。依据基因表达谱芯片数据和查新等不同条件,选择了 FOSB,DNASE1L3,SCARA5和EGR1等四种宫颈癌特异性下调表达候选基因,利用半定量RT-PCR,通过72例组织RNA标本筛查鉴定和统计分析,发现随着宫颈病变进程,上述候选基因的表达水平下调,在CSCC与NC之间,FOSB、DNASE1L3、SCARA5、EGR1等四种基因的转录表达下调,并具有显著差异(P<0.05);CSCC与CIN 比较,只有FOSB和SCARA5基因表达水平差异有统计学差异(P<0.05);CIN与NC 比较,只有DNASE1L3和EGR1基因存在统计学差异(P<0.05)。在此基础上,通过四种基因表达水平的荧光定量RT-PCR鉴定,发现随着宫颈病变过程,上述候选基因的表达水平下调,在NC组织最高,在CIN下降,在CSCC最低。CSCC或CIN与NC 比较,FOSB、DNASE1L3、SCARA5和EGR1等四种基因表达水平存在显著差异(P<0.05),而CIN与NC比较,FOSB、DNASE1L3和EGR1等3种基因的表达水平差异显著(P<0.05),其检测可能有助于鉴别癌前病变,即宫颈癌早期诊断。根据宫颈病变的不同阶段与候选基因表达水平变化的关系,进一步研究不同候选基因表达水平之间的相关性(表3-4),发现EGR1与FOSB、DNASE1L3或SCARA5 具有中度相关性(0.40.05)。通过候选基因表达水平检测对宫颈癌诊断的特异性和灵敏度分析,发现FOSB、DNASE1L3和EGR1等三种基因表达水平检测具有较高的特异性和灵敏度(82.6和80%;82.6和66.0%;81.8和73.3%),根据其ROC曲线的曲线下面积(area under curve,AUC)均大于0.7,也具有较高的准确度,说明三种候选基因检测对宫颈癌有一定的预警价值。结论:通过本研究,又一次证明宫颈癌(维吾尔族妇女宫颈癌)的发生伴随着多种基因的下调表达。EGR1、FOSB和DNASE1L3基因的表达水平变化对维吾尔族妇女宫颈癌的标记作用可能具有一定的代表性,而以EGR1为核心的联合检测对宫颈癌有一定的预警价值。