2005-2006年对三峡库区长江干流及主要支流的渔业资源进行了3次流动调查，共设17个采样点，每次调查时间为1-2个月；同时在巴南和万州进行定点监测，每月2次；结合往年数据资料，对该江段渔业状况进行了分析。主要结果如下：1．长江三峡库区渔获物中鱼类共108种，分属9目20科71属。其中，鲤形目鱼类共71种，占采集鱼类种类总数的65.74％；鲇形目次之，共18种，占16.67％；鲈形目共9种，占8.33％，其它鱼类共10种，占9.26％。2．鲢、南方鲇、鲤、黄颡鱼类、铜鱼、圆口铜鱼、长鳍吻鮈、圆筒吻鮈、长吻鮠、草鱼、(歺又鱼)类等为三峡库区主要经济鱼类。根据各个采样点的调查结果，三峡库区常见种(出现频率大于40％)为14种(类)，按出现率从大到小的顺序排列为：黄颡鱼类(100％)＞南方鲇、鲤、(歺又鱼)类(94.12％)＞鲌类(88.23％)＞鲢(82.35％)＞鲫(70.59％)＞铜鱼、长鳍吻鮈、长吻鮠(58.82％)＞圆口铜鱼、草鱼(52.94％)＞大鳍鳠(47.06％)＞岩原鲤(41.18％)。3．对不同江段主要经济鱼类进行了体长、体重分布及年龄组成分析，发现不同江段渔获物组成存在差异，鱼类中个体小型化、低龄化现象明显。4．统计了不同江段的周年日均单船产量(CUPE)，结合三峡库区各江段干流作业船只的数量(N)及作业天数(T)，根据公式C=(CUPE)·N·T，得出三峡库区长江干流渔业年产量约2046312kg。5．和库区蓄水前相比，现在的捕捞船只数量增加，捕捞强度加大，捕捞效率明显提高。过度捕捞在一定程度上导致了库区鱼类资源的衰退，鱼类种类较以往明显减少，中华倒刺鲃、胭脂鱼和岩原鲤等资源量迅速下降，中华鲟、白甲鱼、鳤、鳡、鯮、鳗鲡等已极难捕到。