论文部分内容阅读
目的探讨中国北方汉族人群树突状细胞相关C型凝集素-1(Dentritic cell associated C type lectin-1, Dectin-1)受体基因rs3901532、rs3901533和树突状细胞-特异性细胞间黏附分子-3结合非整合素(dendritic cell specific ICAM-3-grabbing non-integrin, DC-SIGN)基因rs735239、rs735240、rs4804803、rs2287886位点多态性与真菌性角膜炎易感性之间的关系。方法筛选109例中国北方汉族真菌性角膜炎患者与220例正常对照者,采用序列特异性引物聚合酶链反应(polymerase chain reaction sequencing, PCR)技术获得特定基因目的片段,直接测序检测rs3901532、rs3901533、rs735239、rs735240、rs4804803和rs2287886位点多态性,结合临床资料分析其基因型多态性分布特征、单倍型分布频率及其与真菌性角膜炎易感性之间的关系。采用haploview4.2软件检验Hardy-Weinberg平衡确认标本的群体代表性,并分析各SNP位点之间的连锁关系,数据分析采用SPSS17.0软件进行卡方检验和t检验,等位基因的风险概率以相对风险度(OR)和95%可信区间(95%CI)表示。结果1.SNPS Hardy-Weinberg平衡检验正常组的DC-SIGN基因6个SNPs的基因型均符合Hardy-Weinberg平衡(HWE)(χ2值分别为2.3978、3.5448、0.9188、0.1837、1.1151、2.3530,P值分别为0.1215、0.0597、0.3378、0.6683、0.2910、0.1250)。表明该人群各位点基因型频率处于平衡状态,具有群体代表性。2.基因型及等位基因频率比较对SNP组成的基因型及等位基因频率进行比较,结果显示,病例组和对照组的Dectin-1rs3901532、rs3901533和DC-SIGN rs4804803、rs2287886(?)勺基因型及等位基因比较无统计学差异(基因型分析：χ2=0.251,P=0.882；χ2=0.105,P=0.949；χ2=1.80,P=0.407；χ2=1.795,P=0.407。等位基因分析：χ2=0.021,P=0.883；χ2=0.003,P=0.955：χ2=1.870,P=0.171；χ2=1.774,P=0.183)。两组rs735239和rs735240位点的基因型及等位基因比较有统计学差异(基因型分析：χ2=7.882,P=0.019；χ2=6.832,P=0.003。等位基因分析：χ2=8.62,P=0.003；χ2=6.063,P=0.014)。结合病情程度及病史分析,病例组与正常对照组比较无统计学差异(P>0.05)。3.单倍型分析Dectin-1基因的rs3901532、rs3901533两个SNPs位于同一连锁不平衡区域内(D1statistic=0.991),构成4种单倍型：GT、AG、AT和GG,其中GT和AG两种单倍型包含了99%以上研究人群,两组人群的单倍体型分布频率无显著差别。DC-SIGN基因的rs4804803、rs2287886两个位点位于同一连锁不平衡区域内(D’statistic=0.952),有4种单倍型：TT、TC、CC和CT,其中前三种单倍型包含了99%以上研究人群,其中T-C单倍型两组中分布差别有统计学意义(χ2=7.19,P=0.007)；rs735239和rs735240位于一个连锁不平衡区域,其中单倍体型AG在两组的分布频率比较有统计学差异χ2=6.06,P=0.014),G-A在两组的分布频率比较有显著的统计学差异(χ2=8.62,P=0.003)。其余单倍型分布频率在两组中无显著差异(P>0.05)。结论1. DC-SIGN rs735239、rs735240SNPs与中国北方汉族人群真菌性角膜炎的易感性相关。Dectin-1rs3901532、rs3901533和DC-SIGN rs4804803、rs2287886位点多态性与真菌性角膜炎的易感性无关。2. DC-SIGN rs735239和rs735240构成的单倍型AG和GA、rs4804803和rs2287886位点构成的单倍型TC与真菌性角膜炎易感性相关。Dectin-1rs3901532和rs3901533、DC-SIGN rs735239和rs735240、DC-SIGN rs4804803和rs2287886分别位于同一连锁不平衡区域内并高度连锁。