高技术产业以其高渗透性、高附加值性等优点,日益成为各个国家和地区关注和竞争的焦点,其产业发展水平成为衡量一个国家和地区经济实力和竞争力的重要标志。作为在最新的科学技术成果基础上建立起来的产业,技术创新对高新技术企业的成长十分重要,是高技术产业不断进步发展的引擎。近年来,高技术产业技术创新一再得到政府及社会各界的高度重视,高技术产业技术创新投入不断提高,并在一定程度上提升了技术创新水平。但是对于仍处于发展阶段的我国,研发资金和研发人员等技术创新资源都属于稀缺资源,投入不可能无限增加,要想获得持续的增长,在提高产业创新投入的同时,更应注重技术创新效率的提高。而在提高技术创新效率的过程中,首先要解决的是如何评价高技术产业的技术创新效率问题。本文的研究为评价高技术产业技术创新效率提供了新的思路和方法,为提升我国各地区高技术产业技术创新效率、增强高技术产业竞争力提供理论参考和借鉴依据,具有一定的理论意义和现实意义。本文在技术创新理论与效率理论以及国内外相关文献研究的基础上,首先从技术创新投入产出角度,将技术创新过程分为技术开发和成果转化两个阶段,并与其对应技术开发效率、成果转化效率、技术创新效率等相关概念进行界定；其次,在技术创新两阶段的基础上,通过分析技术创新过程中每个阶段投入产出要素,分别构建技术开发阶段和成果转化阶段投入产出指标体系,并最终得到了高技术产业技术创新效率评价指标体系；然后,突破了传统DEA模型在测算技术创新效率方面的局限性,构建链式网络DEA模型,评价基础两阶段技术创新过程的高技术产业整体技术创新效率及两个子阶段的效率；最后,运用链式网络DEA模型对我国25个地区2000-2010年的高技术产业技术创新效率和技术开发效率、成果转化效率分别进行测算,并根据测算结果对我国高技术产业技术创新效率进行实证分析,为提供政策建议提供了参考依据。