miR-155、miR-32基因在肺癌中的突变分析

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目的:通过PCR-SSCP方法检测石蜡包埋肺癌组织及石蜡包埋癌旁正常肺组织中miR-155、miR-32基因的突变情况,以期探讨其在肺癌发生发展中的作用机制。方法:120例石蜡包埋肺癌组织和42例石蜡包埋癌旁正常肺组织采用蛋白酶K消化酚-氯仿抽提法提取基因组DNA,应用聚合酶链反应-单链构象多态性(polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphsim,PCR-SSCP)检测其中miR-155、miR-32基因突变情况。统计处理均在SPSS 13.0软件上进行,实验数据采用x2检验和秩和相关分析(Spearman相关分析)进行分析,以P<0.05为有统计学意义。结果:(1) DNA提取结果所有标本均成功提取基因组DNA,1%琼脂糖电泳结果示石蜡包埋肺组织提取基因组DNA降解较明显,与全血、新鲜组织中提取基因组DNA电泳图明显不同。所有标本均在紫外分光光度仪下测定,确定每一标本OD260/OD280大于1.75以保证DNA纯度,加入适量TE缓冲液调整DNA浓度使其保持在20~50ng/μl之间。(2) PCR结果miR-155,miR-32基因在120例肺癌组织和42例癌旁正常肺组织中均全部扩增成功,扩增产物在1%琼脂糖凝胶电泳检测均显示单一条带,扩增的DNA片段均无明显的插入或缺失。(3) SSCP结果miR-155扩增产物在120例肺癌组织和42例癌旁正常肺组织中未检出异常。miR-32扩增产物在42例癌旁正常肺组织中未检出异常,在120例肺癌组织中检出32例发生突变,突变率26.67%。miR-32基因突变与肺癌的病理类型、淋巴结转移分期、临床分期呈显著相关(P<0.05)。进一步行Spearman相关分析显示miR-32基因突变与病理类型呈显著正相关(rs=0.200,P=0.028),miR-32基因突变与淋巴结转移呈显著正相关(rs=0.219,P=0.019),miR-32基因突变与临床分期无明显相关性(rs=0.178,P=0.052)。结论:miR-155在石蜡包埋肺癌组织中未检出异常。miR-32基因在肺癌组织中突变率为26.67%,与病理分期、淋巴结转移呈显著正相关,与其可能靶基因MMP-1在肺癌中的作用相一致,说明miR-32基因突变有可能导致肺癌,尤其是肺鳞癌的产生,及促进淋巴结的转移。
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