通过生物信息学方法研究CXXC5在乳腺癌各亚型中的表达及预后分析

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目的本研究通过生物信息学方法分析CXXC锌指蛋白5(CXXC-type zinc finger protein 5,CXXC5)在乳腺癌各亚型中的表达情况和预后分析,旨在为以后乳腺癌的个体化和精准化的诊断与治疗提供新的靶点。方法通过分析GEO数据集GDS5666,研究CXXC5在原发性乳腺癌小鼠模型与转移性乳腺癌小鼠模型中的表达量。利用公共数据整合分析平台bc-Gen Ex Miner和TCGA在线分析平台MEXPRESS,研究CXXC5在乳腺癌各分型中的预测意义,并对乳腺癌中CXXC5的相关基因做了GO富集分析。结果CXXC5在转移性乳腺癌小鼠模型中的表达明显高于原发性乳腺癌小鼠模型。并且,在TCGA分析平台MEXPRESS中发现,CXXC5的表达量与乳腺癌ER阳性率成正相关。而且,我们还发现CXXC5是ER+乳腺癌的不良预后因子。但是,在预后较差的basal-like乳腺癌和TNBC中,C XXC5则无法预测其预后。最后我们获得了CXXC5相关基因,并分析得到了这些相关基因的GO富集条目。其中GO:0070062(胞外泌体)具有最多的相关基因;GO:0000122(负调控RNA聚合酶II启动子转录)和GO:0008134(转录因子结合)的相关基因包含CXXC5。结论CXXC5的过表达是ER+乳腺癌中预后不良的重要因素,而且CXXC5在乳腺癌中具有多种生物功能。但是CXXC5在乳腺癌,特别是ER+乳腺癌作用的相关机制还需要进一步研究。
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