科技评估是对科技活动及其效果的评价和估计。对科研机构的评估是科技评估中一项重要内容。如何运用现代科学手段对研究所进行全面、客观、公正、准确的评价，从而达到宏观调控、内部优化之目的，对科研机构的改革和发展具有十分重要的意义。 2004年，国家文物局提出了逐步构筑四层结构的历史文化遗产保护领域科学和技术创新体系的目标。科研基地是四层历史文化遗产保护领域科学和技术创新体系的重要组成部分，是承上启下的重要环节。本文的研究内容就是对现有的文物保护科研机构进行综合评价，从而遴选出符合条件的机构建立科研基地，进行重点扶持。首先从科技评估的相关理论出发，进而深入研究科研机构评估领域的有关理论和评估方法，确定使用多指标综合评价法；参考指标体系的建立步骤，进一步分析国内外有关科研机构的评估实例和发展情况，通过长时间的调研总结出了目前科研机构评估指标体系的一般设计方案；结合文物系统科研机构的特点和现状，建立起文物系统重点科研基地评估指标体系，并进行了实际应用。 本文的创新之处在于，一是对国内外科研机构评估活动的归纳和总结，提出了文物保护科研机构评估的9大测度体系；二是结合文博事业的具体情况，利用科技评估的有关理论和方法，针对文物系统重点科研基地评价工作的实际，建立起具有科学性、合理性、可操作性的综合评估指标体系。