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目的：利用蛋白质组学方法，通过生物质谱分析技术鉴定差异蛋白的分子量及蛋白含量，检索Swiss-Port蛋白质数据库，寻找和甄别与失眠相关及针刺治疗失眠疗效相关的差异蛋白，从蛋白质组学角度探讨失眠的病理变化，并为针刺治疗失眠的作用机制提供实验依据。方法：1.选用清洁级雄性SD大鼠150只随机分为五组：空白对照组、正常捆绑对照组、正常针刺治疗组、模型对照组、模型针刺治疗组。造模方法采用腹腔注射对氯苯丙氨酸混悬液制备大鼠失眠模型。2.失眠模型成功制备后将大鼠断头，取出脑组织，分别提取五组大鼠全脑总蛋白，测定其蛋白浓度；采用双向电泳技术纯化分离出大鼠脑组织内的蛋白质，然后进行考马斯亮兰染色，扫描凝胶图像并获取蛋白质双向凝胶电泳图谱；应用2-DE图谱分析软件“ImageMaster2D Platinum”对双向凝胶电泳图谱进行分析，寻找出五组间差异表达的蛋白质；3.借助Mascot2.2软件检索相应的数据库从中找出差异蛋白表达点，应用基质辅助激光解析电离串联飞行时间质谱（MALDI-TOF/TOF-MS）测肽质量指纹图，检索Swiss-Port数据库，对差异表达的蛋白质点进行鉴定，得出鉴定的蛋白质结果。结果：1.空白对照组与模型对照组比较：消失的蛋白：14-3-3蛋白、去乙酰化酶沉默信息调节因子；表达下调的蛋白：原肌球蛋白、还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶。2.模型针刺治疗组与模型对照组比较：新出现的蛋白：14-3-3蛋白、去乙酰化酶沉默信息调节因子；表达上调的蛋白：原肌球蛋白、微管相关蛋白2激酶、还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶。3.空白对照组与正常捆绑对照组比较：消失的蛋白：原肌球蛋白、还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶；新出现的蛋白：微管相关蛋白2激酶。4.正常捆绑对照组与模型对照组比较：消失的蛋白：14-3-3蛋白、去乙酰化酶沉默信息调节因子；表达下调的蛋白：微管相关蛋白2激酶。结论：1.应用蛋白质组学技术，发现了与失眠相关的蛋白质，以及与针刺治疗失眠疗效相关的蛋白质。2.利用与失眠相关的蛋白质，有助于进一步研究失眠的疾病标记物和药物靶点；利用与针刺治疗失眠疗效相关的蛋白质，可以进一步探讨针刺治疗失眠的分子生物学机制。