【摘 要】
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WRKY转录因子是植物信号网络中不可缺少的部分,是最大的调节子家族之一.本研究从中间锦鸡儿干旱转录组及基因表达检测数据中,挑选出对干旱、冷、盐、碱及ABA都响应明显的CiWR
【机 构】
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内蒙古农业大学生命科学学院,内蒙古自治区植物逆境生理与分子生物学重点实验室,呼和浩特,010018;中国农业科学院草原研究所,农业部草地生态与修复治理重点实验室,呼和浩特,010010
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WRKY转录因子是植物信号网络中不可缺少的部分,是最大的调节子家族之一.本研究从中间锦鸡儿干旱转录组及基因表达检测数据中,挑选出对干旱、冷、盐、碱及ABA都响应明显的CiWRKY12基因,对其进行克隆及生物信息学分析.结果 显示:CiWRKY12基因的开放阅读框为696 bp,编码232个氨基酸,含有一个典型的WRKY保守结构域,属于Group Ⅱc亚族.对转录因子CiWRKY12与其它8种植物的同源蛋白的理化性质和一、二、三级结构进行生物信息学比较分析,发现这9个蛋白无规则卷曲比例较高,大部分属于不稳定蛋白;亚细胞定位预测表明大部分的蛋白定位于细胞核内;多重序列比对显示WRKY保守结构域保守性很高,其三级结构上也呈现较高的相似性,推测这9个转录因子可能具有相似的转录调控功能.通过本研究生物信息学分析将有助于对CiWRKY12深层次功能研究提供借鉴作用.
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