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畜牧生产中造成环境污染最明显的是养猪生产的环境污染问题，集约化养猪生产的环境污染更突出。猪排泄物中含有超过植物需要的过剩的氮和磷，过剩的氮和磷以及氮所产生的氨气挥发造成了环境酸化和对土壤、水源和空气的污染。过去的饲养方式和饲粮配制，所追求的目标使生产性能达到最高水平，而没有特别考虑营养物质的过剩问题。随着公众对环境污染的关注日益强烈，畜牧生产者不得不考虑采取某些措施，尽可能减少猪排泄物所造成的环境污染，氮和磷是猪粪尿中造成环境污染的主要物质，另一种污染情况是饲料添加物所造成的污染。