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目的：探讨微生物检验应用于腹泻患儿临床诊疗中的价值。方法：选择我院2012年1月～2015年12月收治腹泻患儿80例，随机分成观察组和对照组各40例，其中观察组采取微生物检验，对照组不采取微生物检验，将两组患儿的感染程度、治愈率进行分析比较。结果：本次研究中，对照组患儿治愈率为77.50%，观察组患儿的治愈率达97.50%，观察组明显高于对照组治愈率，两组的差异具有统计学意义（P＜0.05）；同时，观察组轻度感染例数多于对照组，而重度感染例数少于对照组，差异具有统计学意义（P＜0.05）。结论：微生物检验应用于腹泻患儿临床诊疗，能够有效控制患儿的感染，有效提高患儿的治愈率，具有广泛的临床应用价值，值得研究和推广应用。