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加快科技创新，提升福建民营经济对于建设海峡西岸经济区具有重要意义。通过选择R＆D水平与专利授权量两个科技创新的主要因素，结合福建实际，对科技创新与民营经济发展进行相关性分析，具体分析当前制约福建民营经济科技创新的主要因素及其深层原因，从而探讨新时期福建民营企业科技创新、提升核心竞争力的模式选择，并提出加快科技创新、提升福建民营经济的基本思路。